针对员工档案有问题且员工不肯退休的情况，首先需要明确的是，退休手续的办理通常与员工的档案信息紧密相关，尤其是年龄、工龄等关键信息。若档案存在问题，确实可能影响到退休手续的顺利办理。但员工不肯退休，可能涉及多种原因，包括但不限于对档案问题的担忧、对退休待遇的不满、个人职业规划等。以下是从不同角度给出的分析和建议：
一、档案问题的处理
核实档案问题：
- 单位应首先与员工沟通，共同核实档案中存在的具体问题，如信息缺失、错误记录或档案遗失等。
- 依据《企业职工档案管理工作规定》等相关法规，单位有责任妥善保管员工档案，并确保其真实性和完整性。
补充或更正档案材料：
- 若档案材料缺失，单位应协助员工从原工作单位、上级主管部门、档案馆等多渠道寻找原始材料，并及时补充入档。
- 若档案记录信息错误，单位应出具正式的更正说明并加盖公章，存入个人档案。若单位不予配合，员工可向上一级社保机构申请行政复议，或直接向人民法院提起行政诉讼。
档案年龄与身份证不符的处理：
- 依据劳社部发〔1999〕8号文件，以档案最先记载的出生时间为准进行认定。
- 若确实存在误差，员工需提供出生证明、户籍底册等权威证据，向档案管理部门和社保机构申请更正。
二、员工不肯退休的应对
了解员工顾虑：
- 单位应与员工进行深入沟通，了解其不肯退休的具体原因，如是否对档案问题存在担忧、对退休待遇不满、个人职业规划等。
提供法律咨询和协助：
- 单位可为员工提供法律咨询，解释档案问题对退休手续的影响及解决方案。
- 若员工对退休待遇存在疑虑，单位可协助其查询相关政策，确保退休待遇的准确计算和发放。
协商解决方案：
- 针对员工的具体顾虑，单位可与其协商提出解决方案，如协助补办档案、提供额外的退休福利等。
- 若员工因个人职业规划而不肯退休，单位可与其探讨灵活退休方案，如兼职、顾问等，以满足其个人需求。
三、法律途径与备选方案
劳动仲裁与诉讼：
- 若单位与员工因档案问题或退休手续产生争议，且协商无果，员工可向当地的劳动争议仲裁委员会提起劳动仲裁申请。
- 若对仲裁结果不满意，员工可在法定期限内向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
多元证明与备选方案：
- 在档案问题无法立即解决的情况下，员工可探索是否可通过其他途径（如社保缴纳记录、工作证明等）来证明工作年限和社保情况，以便顺利办理退休手续。
- 单位也可考虑为员工提供备选方案，如暂时保留其职位、提供临时工作等，以减轻其因档案问题而产生的焦虑。
总结与建议：面对员工档案有问题且不肯退休的情况，单位应首先核实档案问题，积极补充或更正档案材料，并与员工进行深入沟通，了解其不肯退休的具体原因。在此基础上，单位可提供法律咨询和协助，协商提出解决方案，并考虑法律途径与备选方案以应对可能的争议。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供帮助。