核心前提：员工在公司借款用于项目，现面临离职情况，需明确借款处理方式及可能涉及的法律责任。

1. 借款性质与合同约定
   首先需明确借款的性质（如是否属于员工因公借款、是否签订书面借款协议）。若借款协议中明确约定了还款期限、方式及离职后的处理条款（如离职时需立即归还剩余借款），则员工应按合同履行还款义务。若未约定或约定不明，需结合公司财务制度及行业惯例判断。

2. 离职时的借款处理

   • 已使用借款：若借款已全部用于项目且项目未完成，员工需与公司协商剩余借款的归还方式（如分期偿还或从工资中扣除）。若公司同意继续由员工负责项目，可约定项目完成后结算；若公司接管项目，员工应归还剩余借款。
     
   • 未使用借款：员工应立即归还未使用的借款部分，避免被认定为侵占公司财产。

3. 法律责任与风险

   • 民事责任：若员工未按约定归还借款，公司可依据《民法典》合同编要求员工承担违约责任，包括返还借款、支付利息或违约金。
     
   • 刑事责任：若员工以非法占有为目的，虚构项目或挪用借款用于个人用途，可能涉嫌职务侵占罪或挪用资金罪，需承担刑事责任。

4. 实务建议

   • 员工角度：离职前应与公司核对借款明细，保留项目支出凭证，避免公司主张未使用借款。若公司要求立即归还全部借款但员工无力偿还，可协商延期或分期还款，并签订书面协议。
     
   • 公司角度：应完善借款审批流程，明确离职时借款处理规则（如从离职结算中扣除），并保留借款协议、项目支出凭证等证据，以备纠纷时使用。

总结：离职时借款的处理需以合同约定和实际使用情况为准，员工应积极与公司沟通，避免法律风险；公司应通过制度规范借款行为，降低纠纷概率。如有具体争议，可进一步提供细节，我将结合证据分析责任。