分公司注销后，与总公司的劳动关系问题需分情况讨论：
分公司注销前已存在的劳动关系
- 若员工是与分公司直接签订的劳动合同，在分公司注销前，该劳动关系是独立存在的，受法律保护。分公司作为用人单位，需承担相应的劳动法律责任。
- 分公司注销后，其民事权利和义务由总公司概括承受。这意味着，原本由分公司承担的劳动法律责任，如支付工资、经济补偿等，将转由总公司承担。因此，员工与分公司的劳动关系在分公司注销后，实际上转化为与总公司的劳动关系，总公司需继续履行原劳动合同中的义务，或与员工协商变更、终止劳动合同。
分公司注销后新产生的劳动关系
- 若分公司注销后，员工再与总公司建立劳动关系，则此时双方建立的是全新的劳动关系，与之前的分公司无关。这种情况下，劳动关系的建立、履行、变更和终止均受总公司与员工之间签订的劳动合同及相关法律法规的约束。
法律建议：
- 对于员工而言，若分公司注销，应及时与总公司沟通，了解自己的劳动关系状态及后续安排。若总公司未主动联系，员工可主动要求总公司出具书面说明，明确双方劳动关系及后续处理方案。
- 对于总公司而言，分公司注销后，应妥善处理与员工的劳动关系问题，包括支付应得的工资、经济补偿等，避免引发劳动争议。同时，总公司也需及时与员工协商变更或终止劳动合同，确保双方权益得到保障。
可能产生的法律后果：
- 若总公司未妥善处理与员工的劳动关系问题，如未支付应得的工资、经济补偿等，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求总公司承担相应的法律责任。
- 若总公司与员工就劳动关系问题产生争议，且无法通过协商解决，双方均可向法院提起诉讼，由法院根据事实和法律作出判决。
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