公司可以通过完善内部管理制度、加强沟通与培训、依法制定合理奖惩措施以及运用法律手段维护权益等方式，在不能对员工进行体罚或不当处罚的情况下维护自身利益。具体分析如下：

1. 完善内部管理制度：

   • 公司应建立一套科学、合理、合法的内部管理制度，明确员工的行为规范、工作职责以及奖惩机制。这些制度应当符合国家法律法规的要求，确保员工的合法权益不受侵犯。
   • 制度中应包含对员工违规行为的处理流程，如警告、记过、降职、解雇等，但这些措施必须基于事实，且程序合法，不能包含体罚或不当处罚的内容。

2. 加强沟通与培训：

   • 公司应加强与员工的沟通，及时了解员工的需求和想法，解决员工在工作中遇到的问题，减少因误解或沟通不畅导致的违规行为。
   • 定期对员工进行法律法规和公司规章制度的培训，提高员工的法律意识和规则意识，使员工明确知道哪些行为是违规的，以及违规后可能面临的后果。

3. 依法制定合理奖惩措施：

   • 公司可以依法制定合理的奖惩措施，如设立奖金、晋升机会等激励机制，以及扣除奖金、降职等惩罚措施。但这些措施必须合法、合理，且与员工的行为性质、情节以及造成的后果相适应。
   • 在实施奖惩措施时，公司应确保程序的公正性和透明性，避免主观臆断和歧视性对待。

4. 运用法律手段维护权益：

   • 如果员工的行为严重违反了公司的规章制度或法律法规，给公司造成了重大损失，公司可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，要求员工承担相应的法律责任。
   • 在处理此类纠纷时，公司应保留好相关证据，如员工违规的记录、造成的损失证明等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的主张。