非盈利性组织发放工资是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律角度：

   • 非盈利性组织，尽管其主要目的不是盈利，但为了维持日常运营和实现其社会目标，往往需要雇佣员工。这些员工为组织提供劳动，理应获得相应的报酬，即工资。
   • 从法律层面讲，非盈利性组织在遵守相关劳动法律法规的前提下，有权与员工签订劳动合同，并按照合同约定支付工资。这既是对员工劳动的认可，也是组织合法运营的一部分。

2. 实际操作角度：

   • 非盈利性组织的资金来源可能包括政府补助、社会捐赠、会员会费等。这些资金在用于组织运营时，自然包括支付员工工资。只要资金来源合法，且用于合法目的（包括支付工资），就是完全合法的。
   • 在实际操作中，非盈利性组织需要建立完善的财务管理制度，确保工资支付的透明度和合规性。这包括制定合理的薪酬体系、按时足额支付工资、代扣代缴个人所得税等。

3. 税务角度：

   • 非盈利性组织在支付工资时，需要按照国家税收法律法规的规定，代扣代缴员工的个人所得税。这是组织的法定义务，也是确保税收公平和合法性的重要环节。
   • 同时，非盈利性组织本身也可能享受一定的税收优惠政策。但这些优惠并不影响其支付工资的合法性，只要组织在享受优惠的同时，遵守相关税收法律法规的规定。

建议与注意事项：

• 非盈利性组织在发放工资时，应确保与员工签订正式的劳动合同，明确双方的权利和义务。
• 组织应建立完善的薪酬管理制度，确保工资支付的公平、透明和合规。
• 在支付工资时，非盈利性组织应依法代扣代缴个人所得税，并按时向税务机关申报缴纳。
• 如果非盈利性组织在工资支付方面遇到任何法律问题或困惑，应及时咨询专业律师或相关机构，以确保组织的合法运营和员工的合法权益。

总之，非盈利性组织发放工资是完全合法的，只要组织在遵守相关法律法规的前提下进行操作即可。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。