结论：员工未上满整月，工资扣除未上满天数的单位部分金额是否违法，需根据具体情况判断，若扣除的是员工应承担的社会保险费用等个人部分，且扣除后工资不低于当地最低工资标准，则不违法；若扣除的是单位应承担的部分或不合理扣除导致工资低于最低工资标准，则可能违法。

分析说明：

1. 工资扣除的合法性基础：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得无故克扣。但劳动者应承担的社会保险费用、个人所得税等个人部分，用人单位可以从工资中代扣代缴。
   • 若用人单位扣除的是员工应承担的社会保险费用、个人所得税等个人部分，且扣除后工资不低于当地最低工资标准，则这种扣除是合法的。

2. 单位部分金额扣除的违法性：

   • 单位应承担的社会保险费用、住房公积金等，是用人单位的法定义务，不得转嫁给劳动者承担。若用人单位扣除的是这部分单位应承担的费用，则属于违法行为。
   • 此外，即使扣除的是员工个人部分，若扣除后工资低于当地最低工资标准，也违反了法律规定，因为最低工资标准是劳动者在法定工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位应支付的最低劳动报酬。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 用人单位在扣除工资时，应明确扣除的项目和金额，并告知劳动者。若劳动者对扣除有异议，用人单位应提供合理的解释和证据。
   • 劳动者在发现工资被不合理扣除时，有权向用人单位提出异议，并要求用人单位纠正。若用人单位拒绝纠正，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

法律建议：

• 对于用人单位：应严格遵守法律法规，不得无故克扣劳动者工资。在扣除工资时，应明确扣除的项目和金额，并确保扣除后工资不低于当地最低工资标准。
• 对于劳动者：应了解自己的工资构成和扣除项目，若发现工资被不合理扣除，应及时向用人单位提出异议，并保留好相关证据。若用人单位拒绝纠正，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 若用人单位违法扣除工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、罚款等。
• 劳动者若因工资被扣除而提起劳动仲裁或诉讼，用人单位可能需承担支付工资、经济补偿金等法律责任。