工厂年底不结清工资，在大多数情况下是不合法的，但也存在一些特殊情况可能合法。以下是对此问题的详细分析：

一、一般情况：不合法

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这表明，按月支付工资是用人单位的基本义务。如果工厂无正当理由到年底都不结清工资，就构成了拖欠工资的违法行为。

进一步地，如果用人单位未及时足额支付劳动报酬，劳动者有权依据《中华人民共和国劳动合同法》的规定解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。同时，劳动行政部门也有权责令用人单位限期支付劳动报酬，逾期不支付的，还需按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。

二、特殊情况：可能合法

尽管一般情况下年底不结清工资是不合法的，但也存在一些特殊情况可能使得这种行为合法：

1. 约定支付周期非按月：如果用人单位与劳动者在劳动合同中有明确约定工资支付周期并非按月，例如按季度、按项目结算等，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，同时用人单位按照约定时间和方式支付了工资，那么年底不结清工资在这种情况下是合法的。

2. 不可抗力因素：如遇自然灾害、战争等不可预见、不可避免且无法克服的情况，导致用人单位确实无法按时支付工资，只要用人单位及时向劳动者说明情况，并在不可抗力因素消除后尽快支付工资，一般也不属于违法行为。

3. 生产经营困难：若单位因生产经营困难暂时无法按时发工资，但只要与劳动者进行了沟通并说明情况，且在之后补发了工资，这种行为通常也不被视为违法。不过，这种情况下用人单位可能需要承担一定的举证责任，以证明其确实存在生产经营困难。

三、劳动者权益保护

对于劳动者而言，如果遇到工厂无缘无故地拖欠工资或找各种理由不发工资的情况，应积极维护自己的合法权益。具体途径包括：

1. 与用人单位协商：首先尝试与工厂负责人或人力资源部门沟通，提醒其工资未结清的情况，并询问原因，要求及时支付。在协商过程中，务必保留好相关的聊天记录、通话录音等证据。

2. 向劳动行政部门举报投诉：如果协商无果，可以向当地劳动监察部门提交投诉书及证明劳动关系的材料（如劳动合同、工作证、考勤记录、工资条等），由劳动行政部门进行调查处理。

3. 申请调解、仲裁或提起诉讼：依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动者在协商不成后，可向调解组织申请调解，调解不成则可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可向人民法院提起诉讼。

4. 申请支付令：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者在工资被拖欠时，可向人民法院申请支付令，要求工厂支付拖欠的工资。

四、注意事项

• 证据保留：在整个维权过程中，劳动者应确保保留好所有与工资相关的证据，包括但不限于劳动合同、工资条、银行转账记录、考勤记录等。
• 及时行动：一旦发现工资被拖欠，劳动者应尽快采取行动，以免错过维权时效，特别是仲裁时效和诉讼时效。
• 合理选择：劳动者应根据自身实际情况和维权成本，合理选择最适合自己的维权方式。

综上所述，工厂年底不结清工资是否合法需根据具体情况来判断。在大多数情况下，无故拖欠工资是违法的；但在特定情况下，如存在合法约定或不可抗力因素等，年底不结清工资可能并不构成违法。无论何种情况，劳动者都应了解自己的权益并采取相应措施来保护自己。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。