结论：连续请假遇到周日是否扣工资，需根据请假类型、公司规章制度及劳动合同约定综合判断。以下分情况详细说明：

1. 请假类型为带薪假（如年假、病假等）

• 法律背景：根据《企业职工带薪年休假实施办法》及《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》，带薪假期间（包括周末）应视为正常出勤，公司不得扣减工资。
• 示例：若员工请5天年假，期间包含1个周日，公司应全额支付5天工资，不得因周日而扣减。
• 建议：核对劳动合同及公司规章制度，确认请假类型是否属于带薪假范畴。

2. 请假类型为无薪假（如事假）

• 法律背景：事假通常为无薪假，公司可根据实际出勤天数计算工资。若周日属于公司正常休息日（如双休制），则无需扣减工资；若周日为工作日（如单休制），则可能按缺勤处理。
• 示例：
  • 公司实行双休制，员工请3天事假（含1个周日），公司仅扣减2天工资。
  • 公司实行单休制，员工请3天事假（含1个周日，且该周日为公司工作日），公司可能扣减3天工资。
• 建议：确认公司作息制度及工资计算方式，避免因信息不对称导致纠纷。

3. 公司规章制度或劳动合同有特殊约定

• 法律背景：根据《劳动合同法》第17条，劳动合同可约定工资支付方式、请假规则等。若公司规章制度或劳动合同明确规定“请假期间遇周末需扣减工资”，且该规定不违反法律强制性规定（如最低工资标准），则可能被认定为有效。
• 示例：某公司劳动合同约定“事假期间，每日按基本工资的80%支付，周末不计入出勤”，则员工请假遇周末时，公司可按约定扣减工资。
• 建议：仔细审查劳动合同及公司规章制度，若发现不合理条款（如“请假遇周末双倍扣减”），可与公司协商修改或向劳动监察部门投诉。

4. 特殊情形：病假与医疗期

• 法律背景：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，病假期间（包括周末）应计入医疗期，公司不得随意扣减工资。但医疗期满后仍不能工作的，公司可按相关规定处理。
• 示例：员工因病请假1个月（含4个周末），公司应全额支付病假工资（通常为基本工资的70%-100%，具体比例因地而异）。
• 建议：保留医疗证明等材料，确保病假合法性。

行动建议

1. 核对合同与制度：首先查看劳动合同及公司规章制度，明确请假类型、工资计算方式及周末处理规则。
2. 与公司沟通：若对扣减工资有异议，可与公司人力资源部门沟通，要求提供书面依据。
3. 保留证据：保存请假申请、工资条、公司通知等材料，以备维权之需。
4. 咨询律师：若公司行为涉嫌违法（如恶意扣减工资），可直接向我咨询，我将协助您通过劳动仲裁或诉讼维护权益。

总结：连续请假遇周日是否扣工资，无统一答案，需结合请假类型、公司制度及合同约定判断。建议优先通过沟通解决，若无法达成一致，可依法维权。