在双方构成委托合同关系，但原告主张民间借贷关系的情况下，处理方式需根据具体案情和证据来综合判断，以下是一些可能的处理方向和建议：

1. 审查合同内容与实际履行情况

   • 合同内容：首先，要详细审查双方签订的合同，确认合同中是否明确约定了委托事项、权利义务、费用支付等关键条款。如果合同内容明确体现了委托合同的特征，如一方委托另一方处理特定事务，并支付相应报酬，那么这通常将作为认定委托合同关系的重要依据。
   • 实际履行：同时，要关注双方在实际履行过程中的行为。如果双方确实按照委托合同的约定进行了操作，如委托方提供了必要的信息和资源，受托方完成了委托事项并提交了成果，那么这进一步支持了委托合同关系的成立。

2. 分析原告主张民间借贷关系的依据

   • 借款凭证：原告主张民间借贷关系，通常需要提供借款合同、借条、转账记录等证据来证明双方之间存在借贷合意和资金交付的事实。如果原告无法提供这些关键证据，或者提供的证据不足以证明借贷关系的存在，那么其主张可能难以得到法院的支持。
   • 资金用途与流向：此外，还要关注资金的用途和流向。如果资金确实用于了委托事项的处理，且双方对此有明确的约定或认可，那么这更倾向于支持委托合同关系，而非民间借贷关系。

3. 法律适用与举证责任

   • 法律适用：在处理此类纠纷时，法院将根据双方提供的证据和法律规定来认定法律关系。如果证据充分且符合委托合同关系的特征，法院将倾向于认定双方构成委托合同关系；反之，如果证据不足以证明委托合同关系的存在，且原告主张的民间借贷关系有充分证据支持，法院则可能认定双方构成民间借贷关系。
   • 举证责任：在诉讼过程中，双方都需要承担相应的举证责任。原告需要证明其主张的民间借贷关系的存在，而被告则需要证明双方实际构成的是委托合同关系。如果一方无法提供充分证据支持其主张，将可能承担不利的法律后果。

4. 可能的法律后果与建议

   • 法律后果：如果法院最终认定双方构成委托合同关系，那么原告基于民间借贷关系的主张将被驳回，双方将按照委托合同的约定来履行各自的权利义务。如果法院认定双方构成民间借贷关系，那么被告将需要承担还款责任，并可能面临利息、违约金等额外费用的支付。
   • 建议：针对此类纠纷，建议双方在签订合同时明确约定法律关系和权利义务，以避免后续产生争议。在诉讼过程中，双方应积极提供证据支持自己的主张，并寻求专业律师的帮助以更好地维护自己的合法权益。

综上所述，处理此类纠纷需要综合考虑合同内容、实际履行情况、原告主张的依据以及法律适用和举证责任等多个方面。如果你面临此类问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律建议。