若民间借贷原告起诉的代理人本身在本案中有纠纷，需要分情况讨论其代理资格及后续处理方式，具体如下：

1. 代理人与案件存在直接经济利益冲突
   若代理人是本案的共同借款人、担保人，或与原告/被告存在其他直接经济往来（如代理费与案件结果挂钩），则属于《民事诉讼法》第62条明确禁止的“与本案有利害关系”的情形。此时代理人无权继续代理，法院会依职权或依被告申请要求其退出，否则可能面临罚款、拘留等司法制裁。

2. 代理人与案件存在间接关联但非直接利害关系
   若代理人仅是原告的亲属、朋友，或与案件无直接经济往来（如单纯提供法律咨询但未收取与结果挂钩的费用），则需进一步审查其是否可能影响公正审理。例如：

   • 若代理人是原告的配偶且案件涉及夫妻共同财产，可能因“利益关联”被质疑代理资格；
     
   • 若代理人是被告的前员工，可能因“情感倾向”被要求回避。
     此类情况下，法院会结合具体关联程度、案件性质综合判断，必要时可要求代理人签署《利益冲突声明》或更换代理人。

3. 代理人存在隐瞒利益冲突的情形
   若代理人明知自身与案件有利害关系却故意隐瞒（如未在授权委托书中披露），可能构成《律师法》第49条规定的“违反忠实义务”，原告可解除委托关系并要求赔偿损失；若代理人是律师，还可能面临律师协会的纪律处分。

给你的建议：

• 若你是原告，需立即核查代理人与案件的关联性（如是否为共同借款人、担保人），若存在直接利益冲突，应尽快更换代理人并重新提交授权委托书；
  
• 若你是被告，可在答辩期内向法院提交《代理人回避申请书》，附上代理人与案件存在利害关系的证据（如转账记录、合同等），要求法院裁定其退出；
  
• 若案件已进入审理阶段，可申请法院中止审理，待代理人资格问题解决后再恢复程序。
  

民间借贷案件中，代理人的资格直接影响程序公正，务必谨慎处理。若有具体证据或细节需要进一步分析，可以直接向我咨询。