结论前置：公司与公司签订合同后，法人个人再与对方公司签订个人担保函，这一行为本身是合法的，但需满足一定条件并注意潜在风险。

1. 合法性分析：

• 法律基础：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，担保合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同有效的，担保合同一般也有效，但法律另有规定的除外。因此，在公司间合同有效的基础上，法人个人作为担保人签订担保函，并不违反法律的强制性规定，是合法的。
• 担保人资格：法人个人作为具有完全民事行为能力的自然人，有权作为担保人提供担保。只要其具备担保能力，即拥有足够的财产或信用来承担担保责任，就可以签订个人担保函。

2. 注意事项与潜在风险：

• 担保范围与期限：法人个人在签订担保函时，应明确担保的范围（如本金、利息、违约金等）和期限。若未明确约定，可能承担不必要的担保责任。
• 公司财产与个人财产区分：法人个人作为担保人时，需注意区分公司财产与个人财产。若因担保导致个人财产被执行，可能影响法人个人的其他经济活动。
• 反担保措施：为降低风险，法人个人可以要求债务人提供反担保措施，如抵押、质押或保证等。这样，在债务人无法履行债务时，法人个人可以通过行使反担保权利来减少损失。
• 合同审查与法律咨询：在签订担保函前，法人个人应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、合规。同时，建议咨询专业律师，以获取更全面的法律意见和风险评估。

3. 实际操作建议：

• 明确担保意图：法人个人在签订担保函前，应明确自己的担保意图和承担的风险。若对担保责任有疑虑或不确定，应及时与对方公司沟通并寻求法律意见。
• 保留相关证据：在签订担保函过程中，法人个人应保留所有与担保相关的文件、邮件、短信等证据。这些证据在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。
• 关注债务人动态：作为担保人，法人个人应关注债务人的经营状况和财务状况。若发现债务人出现经营困难或财务危机等迹象，应及时采取措施以降低自己的担保风险。

4. 法律后果：

• 若债务人履行债务：则法人个人作为担保人的责任消灭，无需承担任何法律责任。
• 若债务人未履行债务：则对方公司有权要求法人个人承担担保责任。此时，法人个人需根据担保函的约定履行相应的义务，如支付本金、利息、违约金等。若法人个人拒绝履行或无力履行，对方公司可以通过法律途径追究其法律责任。

总结与建议：公司与公司签订合同后，法人个人再与对方公司签订个人担保函是合法的，但需满足一定条件并注意潜在风险。在实际操作中，建议法人个人明确担保意图、保留相关证据、关注债务人动态，并在必要时咨询专业律师以获取更全面的法律意见和风险评估。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。