结论前置：工人已离职公司一直申报工资，其行为是否违法并是否会被罚款需根据具体情况判断。若存在合理补发、财务调整等合法情形，则不违法也不会被罚款；若为虚增成本偷逃税款或侵犯个人权益，则属于违法行为，公司可能会面临税务部门的处罚。
一、不违法且不会被罚款的情况
合理补发工资或奖金
- 若员工离职前有未结算清楚的工资、奖金、提成等劳动报酬，公司在离职后进行补发，并按照规定申报个人所得税，这是合理合法的行为。例如，销售员工在离职前有一笔较大的销售提成未发放，公司在核算清楚后于离职次月发放并申报相应工资薪金所得，此情况不违反法律规定，也不会被罚款。
财务处理或申报调整的特殊需要
- 因财务核算周期、税务申报系统要求等客观原因，可能存在时间差或对前期申报数据进行合理调整的需求。如公司在某月份发现上一季度对某离职员工的工资薪金申报有误，需在后续月份进行更正申报。只要这种调整基于真实的业务情况且符合相关规定，就不构成违法，也不会被罚款。
二、违法且可能会被罚款的情况
虚增成本偷逃税款
- 公司为减少企业所得税应纳税额，通过虚假申报离职员工工资来虚增企业成本费用，此行为违法。依据《中华人民共和国税收征收管理法》，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或在帐簿上多列支出，不缴或少缴应纳税款的，构成偷税。税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。在这种情况下，公司不仅会被罚款，还可能面临更严重的法律后果。
侵犯个人权益
- 公司未经离职员工同意，利用其身份信息进行不实工资申报，可能对员工个人的税收记录、社保记录产生不良影响，侵犯员工合法权益。根据《中华人民共和国民法典》关于保护个人信息和权益的规定，离职员工有权要求公司停止侵权行为并赔偿损失。虽然这种情况不直接导致公司被税务部门罚款，但员工可以通过法律途径要求公司承担民事责任。
违反劳动法及劳动合同法
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。若公司已为员工办理离职手续并结清工资，但仍在申报该员工工资，则违反了上述法律规定。虽然这种违法行为不直接导致罚款，但员工可以向劳动监察部门投诉，要求公司改正并可能获得赔偿。不过，如果这种行为被税务部门发现并认定为偷税行为，则公司会面临税务部门的处罚。
三、法律后果与应对措施
法律后果
- 税务部门在核实公司违法申报工资的情况后，可能会对公司进行相应的处罚，包括追缴税款、滞纳金和罚款等。
- 离职员工可依据相关法律，要求公司支付由此产生的经济损失，并通过法律途径维护自己的合法权益。
应对措施
- 及时沟通：离职员工应首先与公司沟通，要求其立即停止申报工资并办理相关注销手续。
- 向税务部门说明情况：若公司不予配合，离职员工可向当地税务部门说明情况，并提供相关证据（如离职证明、工资发放记录等）。
- 法律途径维权：若沟通无果，离职员工可通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，工人已离职公司一直申报工资是否违法并会被罚款，取决于公司的具体行为和目的。如果公司存在违法行为，离职员工应积极采取措施维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。