结论：过年期间休了九天，工资只发了21天是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。
分析：
法定节假日与休息日：
- 过年期间通常包含法定节假日（如春节）和休息日。法定节假日是带薪的，即员工在法定节假日休息，用人单位也应支付工资。
- 休息日（如周末）则不一定带薪，除非用人单位有特别规定或劳动合同中有约定。如果休息日员工未工作，用人单位通常不支付工资；如果休息日员工工作了，则用人单位应支付加班费。
工资计算方式：
- 如果这九天中包含了法定节假日，且员工在法定节假日未工作，那么用人单位应支付这法定节假日的工资。
- 如果这九天中包含了休息日，且员工在休息日未工作，那么用人单位可能不支付这休息日的工资（除非有特别规定或约定）。
- 工资只发了21天，可能是用人单位在计算工资时，排除了某些休息日或未将法定节假日的工资计算在内。
合法性判断：
- 如果用人单位在计算工资时，未将法定节假日的工资计算在内，或者错误地将休息日视为无薪日（且没有特别规定或约定），那么这种做法可能是不合法的。
- 如果用人单位有明确的规章制度或劳动合同中约定了休息日无薪，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位的做法可能是合法的。但这种情况较为少见，因为通常休息日工作需要支付加班费。
建议：
- 查看劳动合同和规章制度：首先，员工应查看自己的劳动合同和用人单位的规章制度，了解关于工资支付、法定节假日和休息日的规定。
- 与用人单位沟通：如果员工认为自己的工资被错误计算，可以与用人单位的人力资源部门或财务部门沟通，了解工资计算的具体方式和依据。
- 寻求法律援助：如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
示例：
假设过年期间有3天法定节假日和6天休息日，员工在这9天都未工作。如果用人单位的规章制度或劳动合同中规定法定节假日带薪、休息日无薪（且这种规定不违反法律法规），那么用人单位只支付21天（假设一个月30天，扣除9天中的法定节假日3天，实际工作或应支付工资的天数为21天，但这里需要明确的是，通常法定节假日的工资是单独计算的，不包含在“应支付工资的天数”内，此处理解为用人单位可能将法定节假日工资已计入21天中，或存在其他计算方式）的工资可能是合法的（但需注意，这种合法性是基于特定假设的，实际情况可能因用人单位的规定和劳动合同的约定而异）。然而，如果用人单位未将法定节假日的工资计算在内，或者错误地扣除了休息日的工资，那么这种做法就是不合法的。
最终提醒：工资支付问题涉及员工的切身利益，如果员工对自己的工资有疑问或认为被错误计算，应及时与用人单位沟通或寻求法律援助。有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。