结论：法院能否判决公司借款归公司实际控制人，需根据具体情况判断，一般情况下，若借款属于公司财产，法院不会直接判决归实际控制人所有；但在特定情形下，如存在财产混同、恶意转移资产等，法院可能根据相关法律规定作出相应判决。以下从不同角度进行分析：

1. 公司财产独立性原则：

   • 根据《公司法》的相关规定，公司具有独立的法人财产权，公司的财产与股东（包括实际控制人）的财产是相互独立的。这意味着，公司的借款属于公司的财产，而非股东或实际控制人的个人财产。
   • 在正常情况下，法院会尊重公司的财产独立性，不会直接判决公司的借款归实际控制人所有。这是为了保护公司债权人的利益，防止股东或实际控制人滥用公司法人地位，逃避债务。

2. 财产混同情形：

   • 如果实际控制人通过不正当手段，如虚构交易、转移资产等，导致公司财产与其个人财产混同，那么法院在查明事实后，可能会根据《公司法》及相关司法解释的规定，揭开公司面纱，否认公司的独立法人地位。
   • 在这种情况下，法院可能会判决公司的借款（或部分借款）归实际控制人所有，但这实际上是对实际控制人滥用公司法人地位的一种惩罚，而非对公司财产归属的直接认定。同时，这种判决通常也会伴随着对实际控制人其他财产的追索，以保障公司债权人的利益。

3. 恶意转移资产情形：

   • 如果实际控制人为了逃避债务，恶意将公司借款转移至其个人名下或其他关联方名下，那么这种行为可能构成欺诈或恶意串通损害他人利益。
   • 在这种情况下，法院可以根据《民法典》中关于欺诈、恶意串通等规定，判决实际控制人返还借款或承担相应的赔偿责任。但同样，这并非直接认定借款归实际控制人所有，而是对其恶意行为的法律制裁。

4. 特殊情形下的判决：

   • 除了上述情形外，还存在一些特殊情况，如公司实际控制人同时也是公司借款的担保人或共同借款人等。在这些情况下，法院可能会根据具体的合同条款和法律规定，判决实际控制人承担部分或全部还款责任。
   • 但这种判决是基于实际控制人在借款合同中的法律地位和责任，而非直接认定公司借款归其所有。

法律建议：

• 对于公司而言，应建立健全的财务管理制度，确保公司财产与股东（包括实际控制人）的财产相互独立，避免财产混同和恶意转移资产等行为的发生。
• 对于实际控制人而言，应遵守法律法规和公司章程的规定，不得滥用公司法人地位损害公司债权人的利益。否则，将可能面临法律制裁和赔偿责任。
• 如果涉及相关纠纷或诉讼，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的法律策略和应对方案。

可能法律后果：

• 如果法院判决公司借款归实际控制人所有（在特定情形下），实际控制人可能需要承担还款责任或赔偿责任，并可能面临信用受损、资产被查封或冻结等法律后果。
• 同时，如果实际控制人的行为构成犯罪（如职务侵占罪、挪用资金罪等），还可能面临刑事处罚。