工厂被工商局查了，员工工资一般不会因此直接受到影响，但具体情况需根据工厂被查的原因及后续处理情况来分析。以下是从不同角度给出的详细解答：
一、工厂被查的一般影响
工厂被工商局查，通常是因为工厂存在某些违规行为，如生产不合格产品、未按规定办理相关证照、存在安全隐患等。这些违规行为本身并不直接涉及员工工资的发放，因此，在大多数情况下，员工工资不会因工厂被查而立即受到影响。
二、可能影响员工工资的情况
工厂被查导致停产或减产：
- 如果工厂因被查而停产或减产，且这种状态持续较长时间，那么工厂可能会面临资金紧张的问题，进而影响到员工工资的发放。
- 建议：员工应关注工厂的生产状态，及时与工厂沟通了解工资发放情况。如果工厂确实存在资金问题，员工可以与工厂协商分期支付工资或寻求其他解决方案。
工厂被查后涉及法律纠纷：
- 如果工厂因被查而涉及法律纠纷，如被罚款、被要求赔偿等，且这些纠纷导致工厂资金链断裂，那么员工工资的发放也可能会受到影响。
- 建议：员工应关注工厂的法律纠纷进展，了解工厂的财务状况。如果工厂确实无法按时发放工资，员工可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
工厂被查后老板逃逸或工厂倒闭：
- 在极端情况下，如果工厂被查后老板逃逸或工厂倒闭，那么员工工资的发放将面临严重问题。
- 建议：员工应尽快向劳动监察部门投诉，并申请劳动仲裁或提起诉讼，要求工厂支付拖欠的工资。同时，员工还可以关注工厂的资产情况，如有必要，可以申请法院对工厂的资产进行查封、拍卖等，以保障自己的工资权益。
三、员工应如何应对
保持冷静，了解情况：
- 员工在得知工厂被查后，应保持冷静，不要盲目恐慌。及时与工厂沟通，了解被查的原因、后续处理情况以及工资发放计划等信息。
保留证据，依法维权：
- 员工应保留好与工厂签订的劳动合同、工资条、考勤记录等证据材料。如果工厂确实存在拖欠工资的行为，员工可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求工厂支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
关注工厂动态，及时采取行动：
- 员工应密切关注工厂的动态，如工厂是否继续生产、是否涉及法律纠纷等。如果发现工厂存在无法按时发放工资的风险，员工应及时采取行动，如与工厂协商、向相关部门投诉或申请法律援助等。
总之，工厂被工商局查并不一定会直接影响员工工资的发放。但员工应保持警惕，关注工厂的动态和工资发放情况，及时采取行动维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。