结论：在交警无法认定事故责任且扣车两天的情况下，是否需要支付出租车司机的停运损失，需根据事故责任的实际认定情况、双方过错程度以及相关证据来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、事故责任认定与停运损失的关系
责任明确时：如果后续能够明确事故责任，那么根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，有过错的一方应当赔偿对方因此遭受的损失，包括停运损失。停运损失是指因交通事故导致车辆无法从事正常经营活动而产生的合理损失，通常包括车辆维修期间的租金损失或运营收入损失等。
责任不明确时：在交警无法当场认定事故责任，且后续也未能明确责任的情况下，双方可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。在此过程中，如果出租车司机能够提供充分证据证明其停运损失与事故有直接因果关系，且该损失是合理的，那么其有权要求对方承担相应的赔偿责任。然而，如果双方均无法证明对方有过错，或者过错程度相当，那么可能需要根据公平原则来分担损失。
二、扣车期间与停运损失的计算
扣车期间的合理性：交警扣车是为了进行事故调查和责任认定，这是合法的行政行为。在扣车期间，出租车司机确实无法从事正常经营活动，因此可能会产生停运损失。然而，如果扣车时间过长且无正当理由，出租车司机可以依法主张相应的赔偿。
停运损失的计算：停运损失的计算通常需要考虑多个因素，如车辆的运营成本、预期收入、维修时间等。出租车司机需要提供相关证据来证明其停运损失的具体数额。如果双方对停运损失的计算存在争议，可以委托专业机构进行评估或鉴定。
三、法律建议与后续行动
收集证据：无论是作为事故的一方还是出租车司机，都应积极收集与事故相关的证据，如现场照片、视频、证人证言、维修记录等。这些证据将有助于明确事故责任和计算停运损失。
协商与调解：在事故责任不明确或双方对赔偿金额存在争议的情况下，可以尝试通过协商或调解来解决争议。这可以节省时间和成本，并避免不必要的法律纠纷。
诉讼途径：如果协商和调解无法达成一致意见，出租车司机可以向人民法院提起诉讼，要求对方承担相应的赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供充分证据来证明自己的主张。
举例说明：假设在某起交通事故中，交警无法当场认定责任并扣车两天。后续经调查，发现事故是由于一方违反交通规则导致的。那么，违反交通规则的一方应当承担出租车司机在扣车期间及维修期间的停运损失。如果双方均有过错，且过错程度相当，那么可能需要根据公平原则来分担损失。
最后提醒：在处理此类交通事故时，建议保持冷静和理性，积极与对方沟通协商，并寻求专业法律帮助以确保自己的合法权益得到保障。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。