核心结论：在公司上班因工伤休息在家，工资原则上不应被扣除，且在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。以下从不同角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《工伤保险条例》第三十三条规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。

例如，小李在公司工作时受伤，被认定为工伤，需要在家休息3个月进行治疗。在这3个月的停工留薪期内，公司应按照小李受伤前的工资标准，按月向他支付工资，不能扣除。

特殊情况角度

虽然一般情况下工伤休息期间工资不应扣除，但也存在一些特殊情况可能会影响工资的发放：

1. 未认定工伤：如果员工的受伤情况最终未被认定为工伤，那么在休息期间的工资支付就需要按照公司的规章制度以及相关法律法规中关于病假工资的规定来处理。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，企业应按照规定支付病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
   • 假设小张在公司工作时受伤，但经过认定不属于工伤，而是自身疾病导致。小张在公司工作了5年，根据规定他有6个月的医疗期。在这6个月内，公司按照当地最低工资标准的80%向他支付病假工资。
2. 故意或重大过失：如果员工是因为故意或者重大过失导致自己受伤，虽然可能被认定为工伤，但公司可能会根据内部规章制度对员工进行一定的处罚，不过这种处罚通常不能直接体现在扣除工伤休息期间的工资上，而是可能通过其他方式，如绩效扣分、警告等。但如果公司的规章制度明确规定，因员工故意或重大过失导致工伤，在休息期间按照一定比例降低工资支付，且该规章制度经过了民主程序制定并公示，员工也知晓该制度，那么公司可能会按照制度执行。不过，这种规定在实际操作中存在一定争议，需要结合具体情况和当地司法实践来判断。

维权建议角度

如果公司违反规定扣除工伤休息期间的工资，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：首先可以尝试与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，说明自己的情况以及相关法律法规的规定，要求公司按照规定支付工资。
2. 申请劳动仲裁：如果协商无果，员工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请仲裁时，需要提供相关的证据，如工伤认定决定书、劳动合同、工资条等，以证明自己的工伤情况以及公司扣除工资的事实。
3. 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，员工还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

总之，在公司上班因工伤休息在家，在停工留薪期内工资不应被扣除。如果遇到公司违规扣除工资的情况，要及时采取措施维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤方面的问题，可以直接向我咨询。