迟到一分钟扣100元很可能构成违法行为，以下从不同角度为你详细分析：

法律框架与原则

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着用人单位在支付工资时，必须遵循法定标准，不得随意克扣。迟到一分钟扣100元的做法，显然是对工资的不合理克扣，违反了这一原则。

2. 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但经济损失的赔偿可以从劳动者本人的工资中扣除时，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。迟到一分钟通常不会给用人单位造成如此巨大的经济损失，因此扣100元很可能超出了合理赔偿的范围。

具体分析

1. 扣款金额的合理性：

   • 迟到一分钟扣100元，这一金额显然过高，远超出了因迟到可能给用人单位造成的实际经济损失。这种高额罚款很可能被视为对劳动者的不合理惩罚，违反了劳动法的公平原则和工资保护规定。

2. 公司规章制度的有效性：

   • 用人单位有权通过制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理，并经过民主程序制定和公示。如果公司的规章制度中规定了不合理的罚款条款，如迟到一分钟扣100元，这样的条款可能因违反法律法规而无效。员工有权拒绝执行不合理的规章制度，并可以向劳动监察部门投诉举报。

3. 实际执行中的考量：

   • 在实际操作中，如果用人单位确实因为员工的迟到行为遭受了重大损失（这种情况极为罕见，且需要用人单位提供充分证据），可以按照法律规定要求员工赔偿。但这种赔偿应当基于实际损失，并且扣除的金额不得超过法律规定的上限。

法律建议

1. 对于用人单位：

   • 应制定合理的考勤制度和罚款标准，确保既符合法律法规的要求，又能有效管理员工。罚款标准应当与员工的实际损失相匹配，避免过高或过低的罚款。

2. 对于员工：

   • 在面对不合理的罚款时，可以与公司沟通协商，要求公司解释罚款的依据和合理性。如果公司拒绝解释或坚持不合理罚款，员工可以向劳动监察部门投诉举报，以维护自己的合法权益。

总结来说，迟到一分钟扣100元很可能构成违法行为，因为它违反了劳动法的公平原则和工资保护规定。如果你或你身边的人遇到了类似的情况，建议及时与公司沟通协商或向劳动监察部门投诉举报。如果你还有其他法律问题，也可以直接向我咨询。