结论：商铺仅取得竣工验收合格证而消防验收不合格时，房屋买卖合同的效力需根据具体情况综合判断，但通常情况下，消防验收不合格可能影响合同的效力，尤其是在商铺作为公众聚集场所时。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律法规的角度
《民法典》的规定：
- 根据《民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件包括行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实，以及不违反法律、行政法规的强制性规定。
- 商铺若消防标准未通过，可能违反了《消防法》等法律法规的强制性规定，尤其是当商铺属于公众聚集场所时，其消防验收合格是投入使用、营业的前提条件。
《消防法》的规定：
- 商铺作为公众聚集场所，在投入使用、营业前必须经过消防安全检查。未经消防安全检查或者经检查不符合安全要求的，不得投入使用、营业。
- 若商铺消防验收不合格，则可能面临无法投入使用、营业的风险，进而影响房屋买卖合同的履行和效力。
《商品房屋租赁管理办法》的类比适用：
- 虽然该办法主要针对房屋租赁，但其中关于房屋不得出租的情形（如不符合安全、防灾等工程建设强制性标准）对于房屋买卖合同同样具有参考意义。
- 商铺消防验收不合格，可视为不符合安全标准，从而影响合同的效力。
二、合同双方的具体情况
双方的主观意愿：
- 如果买方在签订合同时明知商铺未通过消防验收，但仍愿意购买，并且这种行为没有损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益，那么合同的效力可能会根据具体情况由法院或仲裁机构进行裁决。
- 然而，即使买方明知，商铺消防验收不合格仍可能构成合同履行的障碍，影响合同目的的实现。
合同的履行情况：
- 如果卖方在合同签订后积极采取措施完成消防验收，并最终取得消防合格证，那么合同的效力可能会得到恢复。
- 但若卖方一直未能完成消防验收，导致买方无法正常使用商铺，买方则有权以合同目的无法实现为由要求解除合同，并要求卖方承担违约责任、赔偿损失等。
三、实际案例与风险
- 实际案例：在类似案例中，法院通常会考虑商铺的实际消防状况、合同的有效要件以及相关法律法规的规定。若商铺存在严重消防隐患，严重影响使用安全，法院可能认定合同无效或可撤销。
- 风险提示：对于买方而言，购买消防验收不合格的商铺可能面临无法正常使用、无法办理营业执照、面临行政处罚等风险。对于卖方而言，则可能面临合同解除、违约责任、赔偿损失等法律后果。
四、建议与措施
买方建议：
- 在签订房屋买卖合同前，务必要求卖方提供商铺的消防验收合格证或其他相关证明文件。
- 若商铺消防验收不合格，应谨慎考虑购买，并可在合同中明确约定消防验收的相关条款及违约责任。
卖方建议：
- 在出售商铺前，应确保商铺已通过消防验收并符合相关安全标准。
- 若商铺消防验收不合格，应积极采取措施进行整改，并在整改完成后及时办理消防验收手续。
总结：商铺仅取得竣工验收合格证而消防验收不合格时，房屋买卖合同的效力需根据具体情况综合判断。为确保合同的合法性和有效性，避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议双方在签订合同前充分了解商铺的消防状况，并在合同中明确约定相关条款及违约责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。