派遣员工在工伤期间的工资支付责任主要由劳务派遣单位承担。以下是对此问题的详细分析：
一、法律关系与责任主体
在劳务派遣关系中，劳务派遣单位是用人单位，与派遣员工存在劳动关系，并应履行对劳动者的义务。用工单位（即接受劳务派遣的单位）与派遣员工之间则是劳务关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条的规定，劳务派遣单位应当履行用人单位对劳动者的义务，这包括在工伤期间支付工资的义务。
二、具体支付规则
基本原则：
- 劳务派遣单位应确保工伤职工在停工留薪期间原工资福利待遇不变，并由劳务派遣单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
特殊情况处理：
- 若劳务派遣协议另有约定，且该约定符合法律法规的要求，用工单位可通过协商方式参与支付。但需注意，任何约定都不得免除劳务派遣单位的法定责任，且需保障劳动者实际权益不受损害。
三、支付流程与注意事项
申报流程：
- 工伤发生后，需及时完成工伤认定程序，确认停工留薪期期限。劳务派遣单位应按月足额支付工资，并保留完整支付凭证备查。
特殊情形处理：
- 若停工留薪期超过12个月仍需治疗，需经劳动能力鉴定委员会确认后可适当延长。
- 因伤情严重无法自理者，可依法主张护理费用等额外补偿。
四、争议解决机制
- 当劳务派遣单位与用工单位对支付责任存在分歧时，应优先通过协商解决；协商不成可申请劳动仲裁或提起诉讼，最终由司法机关根据法律规定和实际情况判定责任归属。
五、实际案例与法律后果
- 案例：假设某派遣员工在用工单位工作期间发生工伤，停工留薪期为6个月。根据法律规定，这6个月的工资应由劳务派遣单位支付。若劳务派遣单位未支付，派遣员工有权向劳务派遣单位主张权利，并可通过劳动仲裁或诉讼途径解决。
- 法律后果：若劳务派遣单位未依法支付工伤期间的工资，可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，派遣员工也有权要求劳务派遣单位支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
总结与建议：
派遣员工在工伤期间的工资支付责任主要由劳务派遣单位承担。为确保自身权益，派遣员工在工伤发生后应及时完成工伤认定程序，并保留好相关证据。若劳务派遣单位未支付工资，派遣员工可通过协商、劳动仲裁或诉讼等途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。