结论：公司提供免费住房只交水电费的情况，在符合一定条件下可以抵扣个人所得税，且这种做法本身是合法的。

详细分析：

1. 个人所得税抵扣的合法性：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，个人因任职或受雇而取得的工资、薪金等所得，在计算应纳税所得额时，可以扣除一定的费用。其中，与任职或受雇有关的其他支出，如符合规定的住房补贴等，也可能被视为可扣除项目。
   • 在公司为员工提供免费住房，且员工仅需支付水电费的情况下，这种住房补贴实际上构成了员工收入的一部分（即非货币性福利）。根据税法规定，如果这种补贴符合当地税务机关规定的标准和范围，是可以作为税前扣除项目的。

2. 具体抵扣条件：

   • 合规性：公司提供的免费住房必须符合当地税务机关对于住房补贴的相关规定，包括但不限于住房的面积、位置、租金水平等。
   • 合理性：住房补贴的金额应合理，不能过高或过低，以免被视为逃避税收的手段。
   • 记录与申报：公司需要妥善记录为员工提供的住房补贴情况，并在年度所得税汇算清缴时，按照税务机关的要求进行申报和扣除。

3. 合法性分析：

   • 公司为员工提供免费住房并仅收取水电费的做法，本身并不违反法律法规。只要这种做法符合税法对于住房补贴的相关规定，且公司按照税法要求进行了正确的税务处理，就是合法的。
   • 需要注意的是，如果公司未按照税法规定进行税务处理，如未将住房补贴纳入员工收入进行申报和扣税，就可能构成偷税漏税行为，面临税务机关的处罚。

4. 实际操作建议：

   • 了解当地政策：公司应首先了解当地税务机关对于住房补贴的具体规定和标准，以确保提供的住房补贴符合税法要求。
   • 完善内部管理：公司应建立健全的内部管理制度，妥善记录为员工提供的住房补贴情况，包括住房的地址、面积、租金水平以及员工支付的水电费等。
   • 及时申报与扣税：在年度所得税汇算清缴时，公司应按照税务机关的要求进行申报和扣除，确保税务处理的合规性。

总结与提醒： 公司提供免费住房只交水电费的情况，在符合税法规定和当地税务机关要求的前提下，是可以抵扣个人所得税的，且这种做法本身是合法的。但公司需要确保税务处理的合规性，避免因为操作不当而面临税务风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。