单位在符合法律规定和劳动合同约定的情况下，可以根据劳动纪律对员工进行扣款，但这种扣款必须受到严格的限制，不能随意进行。以下从多个角度为你详细分析：
法律依据与限制
《工资支付暂行规定》的相关规定：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 这意味着，如果员工因违反劳动纪律给单位造成了经济损失，单位可以依法从员工工资中扣除一定比例作为赔偿，但扣除比例和剩余工资有明确限制。
劳动合同与规章制度：
- 单位在制定劳动纪律和扣款规定时，必须确保这些规定符合法律法规，并且已经通过民主程序制定，向员工进行了公示或告知。
- 劳动合同中应明确约定扣款的条件、比例和方式等，以便在员工违反劳动纪律时，单位能够依据合同进行扣款。
扣款的具体情形与限制
员工违反劳动纪律但未造成经济损失：
- 在这种情况下，单位通常不能直接对员工进行扣款。劳动纪律的违反更多应通过警告、记过、降职等纪律处分方式来处理，而不是直接扣款。
- 如果单位试图以违反劳动纪律为由对员工进行扣款，且这种扣款没有法律依据或合同约定，那么员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。
员工违反劳动纪律且造成经济损失：
- 如前所述，单位可以根据《工资支付暂行规定》第十六条的规定，从员工工资中扣除一定比例作为赔偿。
- 但扣除的比例必须严格控制在员工当月工资的20%以内，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
实际操作建议
完善劳动合同和规章制度：
- 单位应确保劳动合同中明确约定了扣款的条件、比例和方式等，以便在需要时能够依法进行扣款。
- 规章制度应经过民主程序制定，并向员工进行公示或告知，以确保其合法性和有效性。
合理行使扣款权利：
- 单位在行使扣款权利时，应确保扣款的原因、比例和方式等均符合法律法规和劳动合同的约定。
- 避免随意扣款或过度扣款，以免引发劳动争议和法律风险。
加强沟通与协商：
- 在员工违反劳动纪律时，单位应首先与员工进行沟通，了解原因并尝试通过协商解决问题。
- 如果确实需要扣款，应向员工说明扣款的原因、比例和方式等，并确保员工对扣款决定无异议。
总结来说，单位在符合法律规定和劳动合同约定的情况下，可以根据劳动纪律对员工进行扣款，但必须受到严格的限制。如果单位试图随意扣款或过度扣款，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。