结论：法院在判决时会综合考虑协议的真实性、双方当事人的真实意思表示以及是否存在欺诈、胁迫等情形。如果两份协议中一份多了“房子归男方”的条款，且该条款是双方真实意思表示，不存在违法情形，那么法院可能会依据该条款进行判决；但如果存在欺诈、胁迫或该条款并非双方真实意思表示，法院则可能不会采纳该条款，而是根据其他证据和事实进行判决。
分析说明：
协议的真实性与有效性：
- 法院首先会审查两份协议的真实性，包括签订时间、签字盖章等是否真实有效。
- 如果能够证明两份协议都是双方真实签订的，且没有违反法律法规的强制性规定，那么这两份协议在法律上都是有效的。
条款的差异与解释：
- 既然两份协议时间相同，但其中一份多了“房子归男方”的条款，法院会关注这一差异。
- 法院会询问双方当事人，了解这一条款是如何产生的，是否是双方真实意思表示。
- 如果男方能够证明这一条款是双方协商一致后添加的，且女方没有提出异议或提供相反证据，那么法院可能会认可这一条款。
欺诈、胁迫等情形的审查：
- 如果女方主张这一条款是在欺诈、胁迫等情形下签订的，法院会进行审查。
- 女方需要提供证据证明自己是在受到欺诈、胁迫等情形下签订的协议，否则法院可能不会采纳其主张。
其他证据与事实的考虑：
- 除了协议本身，法院还会考虑其他证据和事实，如双方当事人的陈述、证人证言、房屋购买记录、付款凭证等。
- 这些证据和事实可能有助于法院更全面地了解案件情况，从而作出更公正的判决。
特殊场景：
- 如果双方当事人在签订协议后，又对房屋归属问题进行了其他约定或行为（如男方实际支付了房屋的全部或部分款项，且女方对此表示认可），这些约定或行为也可能成为法院判决的依据。
行动建议：
- 如果你或对方对协议的真实性、有效性或条款的差异存在争议，建议及时收集相关证据，如协议原件、签订时的照片或视频、证人证言等。
- 在诉讼过程中，要如实陈述事实，提供真实有效的证据，以便法院能够更准确地了解案件情况，作出公正的判决。
- 如果你对法律程序或判决结果存在疑问或不满，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。