关于劳动合同中不定时工作制的执行，这是一个涉及劳动者权益保障的重要问题。下面，我将从法律法规、合同协议、工资支付以及实际操作中的注意事项等多个层面，为您详细解答。

一、法律法规层面

不定时工作制的执行首先需要遵循国家的相关法律法规。根据《中华人民共和国劳动法》及原劳动部的相关文件，企业因生产特点不能实行标准工时制的，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制。这一制度主要适用于高级管理人员、外勤人员、推销人员等因工作无法按标准工作时间衡量的职工。同时，实行不定时工作制的劳动者，虽然不执行加班工资的规定，但其工作时间仍应平均每天原则上不超过8小时，每周至少休息1天，以保障劳动者的正常休息权利。

二、合同协议层面

在劳动合同中，应明确约定不定时工作制的相关内容。这包括：

1. 工作内容和职责：详细列明劳动者的工作内容、任务和职责，避免企业随意增加工作负担。
2. 休息休假方式：尽管工作时间不固定，但企业与劳动者应约定合理的休息休假方式，如周期性休息时间或弹性休息安排，确保劳动者有足够的休息时间。
3. 劳动报酬计算方式：劳动合同需明确劳动报酬的计算方法，通常包括基本工资和绩效工资等部分。基本工资是固定的，而绩效工资则根据员工的工作表现和业绩来发放。同时，应确保劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。

三、工资支付层面

在工资支付方面，不定时工作制下的劳动者不执行加班工资的规定，但用人单位应确保按时足额支付工资。具体来说：

1. 工资构成：不定时工作制下的工资构成通常包括基本工资和绩效工资等部分，具体由用人单位根据自身情况决定。
2. 支付方式：支付方式可以是月薪制或年薪制等，但无论采用何种方式，都应确保工资按时足额支付给劳动者。
3. 保障基本权益：用人单位在执行不定时工作制时，应合理确定劳动定额和计酬标准，以保障职工的基本生活需求。

四、实际操作中的注意事项

在实际操作中，用人单位和劳动者都需要注意以下几点：

1. 避免滥用不定时工作制：用人单位不得擅自扩大不定时工作制的适用范围，更不得以实行不定时工作制为由，随意压缩劳动者的休息时间或降低工资待遇。
2. 加强沟通与协商：在实施不定时工作制前，用人单位应与劳动者进行充分沟通，解释清楚该制度的具体内容和可能带来的影响，以取得劳动者的理解和支持。
3. 完善内部管理制度：用人单位应建立健全考勤和加班审批制度，对实行不定时工作制的员工进行科学管理。同时，要求劳动者记录工作时间、内容和成果，既便于企业管理，也为劳动者维权提供证据支持。
4. 劳动者自身维权：劳动者应了解不定时工作制下的权益和义务，通过学习相关法律法规，提高自我保护能力。同时，妥善保管工作记录、考勤记录、工资条等证据，以便在劳动争议时维护自己的合法权益。

综上所述，不定时工作制的执行需要遵循国家法律法规、明确合同协议内容、合理支付工资，并在实际操作中注意避免滥用、加强沟通与协商、完善内部管理制度以及劳动者自身维权等方面的问题。这样才能确保不定时工作制下的劳动者权益得到有效保障。