结论：会计职务侵占取走公司资金2000万且查不到去向，是可以立案的。以下从多个角度进行详细分析：

一、职务侵占罪的构成要件与立案标准

1. 构成要件：

   • 主体：公司、企业或者其他单位的工作人员。
   • 主观方面：故意，且具有非法占有单位财物的目的。
   • 客体：公司、企业或者其他单位的财产所有权。
   • 客观方面：利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。

2. 立案标准：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
   • 关于“数额较大”、“数额巨大”、“数额特别巨大”的具体标准，虽然法律未明确规定具体数额，但根据司法实践和相关司法解释，通常将数额在6万元以上的认定为“数额较大”，数额在100万元以上的认定为“数额巨大”，数额在1500万元以上的认定为“数额特别巨大”。因此，2000万的侵占金额显然达到了“数额特别巨大”的标准，符合职务侵占罪的立案条件。

二、查不到资金去向对立案的影响

1. 不影响立案的实质条件：

   • 职务侵占罪的立案主要关注的是行为人是否利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，以及数额是否达到立案标准。
   • 资金去向的查证，虽然对于案件的进一步侦查和审判有重要意义，但并不是立案的必要条件。即使资金去向暂时无法查清，只要其他立案条件满足，公安机关仍然可以立案侦查。

2. 可能影响案件的侦查和审判：

   • 资金去向的查证对于确定行为人的犯罪情节、追缴赃款赃物等具有重要意义。
   • 如果资金去向无法查清，可能会给案件的侦查和审判带来一定困难，但并不影响立案的合法性。

三、立案后的法律程序

1. 公安机关立案侦查：

   • 公安机关在接到报案后，会进行初步调查，确认存在犯罪事实且需要追究刑事责任时，会立案侦查。
   • 立案后，公安机关会依法展开侦查活动，包括询问嫌疑人、证人，调取相关证据等。

2. 检察机关审查起诉：

   • 公安机关侦查终结后，会将案件移送检察机关审查起诉。
   • 检察机关会对案件进行全面审查，确认犯罪事实清楚、证据确实充分时，会向法院提起公诉。

3. 法院审判：

   • 法院在接到检察机关的公诉后，会依法进行审判。
   • 如果法院认定行为人构成职务侵占罪，会根据犯罪情节和数额大小等依法判处相应的刑罚。

四、建议与注意事项

1. 及时报案：

   • 一旦发现会计职务侵占行为，公司应立即向公安机关报案，并提供相关证据材料。

2. 配合侦查：

   • 公司应积极配合公安机关的侦查活动，提供必要的协助和支持。

3. 保护证据：

   • 在报案前和报案过程中，公司应注意保护相关证据材料，防止证据灭失或被篡改。

4. 咨询专业律师：

   • 在处理此类案件时，公司可以咨询专业律师的意见和建议，以便更好地维护自身权益。如有问题，可以直接向我咨询。

综上所述，会计职务侵占取走公司资金2000万且查不到去向，是可以立案的。公司应积极配合公安机关的侦查活动，并提供必要的协助和支持，以便尽快查明案件事实、追缴赃款赃物并维护自身权益。