当您在交通事故中遇到对方全责，但对方因手续不全导致保险公司无法赔付修车费用时，您可以按照以下步骤来有效维护自己的合法权益：
一、明确责任与权益
首先，根据交通事故责任认定书，明确对方的全责地位。您有权要求对方赔偿因事故造成的车辆维修费用及其他相关损失。
二、尝试协商与调解
直接协商：
- 与对方进行友好且明确的沟通，指出其应承担的责任，并要求尽快解决赔付问题。
- 保留好与对方的聊天记录或通话录音，作为后续可能的证据。
第三方调解：
- 请求公安机关交通管理部门或人民调解委员会介入调解。
- 在调解过程中，出示交通事故认定书、车辆维修费用清单等证据，以支持您的赔偿请求。
三、考虑保险途径
代位追偿：
- 如果您的车辆投保了车损险，且对方车辆也投保了交强险和商业第三者责任险，您可以向自己的保险公司申请代位追偿。
- 提交代位追偿的书面申请及相关证明材料，如事故责任认定书、维修发票等。
- 保险公司审核通过后，会先行赔付您的修车费用，并依法向对方及其保险公司进行追偿。
了解怠予求偿：
- 在某些地区或特定情况下，如果车辆已修复且您已支付费用，但对方拒绝赔偿，您可以向自己的保险公司咨询是否适用怠予求偿。
- 保险公司可能会通过特定方式证明对方未支付修车款，并在一定条件下直接支付赔偿款给您。
四、采取法律途径
发送律师函：
- 如果协商和调解无果，您可以委托律师向对方发送律师函，明确指出其违约行为及应承担的法律责任。
- 要求对方在规定期限内支付修车费用，否则将采取法律措施。
提起民事诉讼：
- 若对方仍拒绝支付，您可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
- 准备起诉状、事故责任认定书、修车发票、维修清单等相关证据材料。
- 法院立案审查后，将安排开庭审理。在庭审过程中，充分陈述事实和理由，出示相关证据。
- 如法院判决支持您的诉讼请求，而对方仍不履行判决义务，您可以在判决生效后的规定期限内向法院申请强制执行。
五、注意事项
保留证据：
- 在处理此类纠纷时，务必保留好所有相关证据，包括交通事故认定书、现场照片、维修费用清单及发票等。
- 这些证据对于维护您的合法权益至关重要。
注意时效：
- 诉讼时效是维护合法权益的重要因素。请确保在规定的时效内提起诉讼或采取其他法律措施，以免丧失胜诉权。
咨询专业律师：
- 如果您对法律程序或证据准备等方面存在疑问，建议咨询专业律师以获取专业的法律建议和指导。
综上所述，当交通事故中对方全责但因手续不全导致保险公司无法赔付时，您应通过协商、调解、保险途径及法律途径来维护自己的合法权益。在处理过程中，务必保留好相关证据，注意诉讼时效问题，并可寻求专业律师的帮助以确保自身权益得到有效保护。