关于国企招标中由中标公司支付代理费是否违规的问题，这并非一个绝对的“违规”或“不违规”的判断，而是需要根据具体情况和相关法律法规来综合分析。以下是我从不同角度为你进行的详细分析：

1. 招标代理费的支付惯例与合同约定：

   • 在招标活动中，招标代理费通常由招标人（即发起招标的一方，如国企）支付给招标代理机构，这是行业内的普遍做法。然而，这并不意味着中标公司支付代理费就一定违规。关键在于招标文件或相关合同中是否有明确约定由中标公司承担代理费。
   • 如果招标文件或合同中明确规定了由中标公司支付代理费，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么中标公司支付代理费就是合法的。

2. 法律法规的强制性规定：

   • 我们需要查看相关的法律法规，特别是关于招标投标活动的法律法规，如《中华人民共和国招标投标法》等，以确定是否存在禁止中标公司支付代理费的强制性规定。
   • 经过检索，目前并没有明确的法律法规规定中标公司不能支付招标代理费。因此，从法律法规的角度来看，中标公司支付代理费并不直接构成违规。

3. 公平性与合理性考量：

   • 即使法律法规没有明确禁止中标公司支付代理费，我们还需要从公平性和合理性的角度来考量这一做法。如果招标文件或合同中未明确说明代理费由中标公司承担，而在中标后突然要求中标公司支付，这可能对中标公司不公平。
   • 此外，如果代理费金额过高或不合理，也可能引发对招标活动公正性的质疑。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于国企来说，在招标文件中应明确代理费的支付方式和责任方，以避免后续争议。
   • 如果确实需要由中标公司支付代理费，应在招标文件中明确说明，并确保这一做法符合相关法律法规和公平性原则。
   • 对于中标公司来说，在参与招标前应仔细阅读招标文件，了解代理费的支付方式和责任方，以避免不必要的纠纷。

总结来说，国企招标中由中标公司支付代理费并不一定违规，关键在于招标文件或相关合同中是否有明确约定，并且这一约定是否符合相关法律法规和公平性原则。如果你在实际操作中遇到相关问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。