招标代理费由施工单位承担是否违法，需分情况讨论：
若招标文件或合同中明确约定由施工单位承担招标代理费：
- 在这种情况下，招标代理费由施工单位承担并不违法。因为招标文件和合同是双方意思自治的体现，只要其中的条款不违反法律、行政法规的强制性规定，就是合法有效的。施工单位在参与投标或签订合同时，应当仔细阅读招标文件和合同条款，了解并接受其中的费用承担约定。
若招标文件或合同中未明确约定招标代理费的承担方：
- 此时，招标代理费的承担可能需要根据相关法律法规和行业惯例来判断。一般来说，招标代理费是招标人为了完成招标活动而支付的费用，理论上应由招标人承担。但是，如果在实际操作中，招标人通过某种方式（如将费用转嫁到投标报价中）让施工单位承担了这部分费用，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有损害施工单位的合法权益，那么这种做法可能不会被认定为违法。然而，如果招标人强制要求施工单位承担招标代理费，且没有合理的依据或合同约定，那么这种做法可能涉嫌违法，施工单位可以依法维护自己的权益。
从法律原则和行业惯例的角度分析：
- 法律原则方面，招标投标活动应当遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。如果招标人强制要求施工单位承担招标代理费，且没有合理的依据或合同约定，那么这种做法可能违反了公平原则，损害了施工单位的合法权益。
- 行业惯例方面，招标代理费通常由招标人承担。这是因为招标代理服务是招标人为了完成招标活动而购买的服务，其费用应当由招标人支付。当然，如果行业内有特殊的惯例或做法，且得到了相关法律法规的认可或支持，那么也可以按照行业惯例来执行。
建议：
- 对于招标人来说，应当在招标文件中明确招标代理费的承担方，避免后续产生纠纷。如果希望施工单位承担部分或全部费用，应当在招标文件中明确约定，并确保约定合法合规。
- 对于施工单位来说，在参与投标或签订合同时，应当仔细阅读招标文件和合同条款，了解并接受其中的费用承担约定。如果认为费用承担约定不合理或违法，可以及时向招标人提出异议或寻求法律帮助。
可能产生的法律后果：
- 如果招标人强制要求施工单位承担招标代理费且没有合理的依据或合同约定，施工单位可以依法向相关部门投诉或提起诉讼，要求招标人承担违法责任并赔偿损失。
- 如果施工单位在不知情或被迫的情况下承担了招标代理费，且后续发现该费用承担约定违法或不合理，也可以依法维护自己的权益。
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