结论：员工未按时上班扣工资属于劳动纠纷范畴，报警一般不是首选处理方式，通常应通过劳动仲裁或协商解决；若因扣工资引发冲突等治安问题，报警可处理冲突，但工资纠纷本身仍需按劳动法律途径解决。以下是详细分析：

从报警处理冲突角度

如果因为公司扣了未按时上班员工的工资，员工与公司之间发生了激烈的冲突，比如员工情绪激动与公司人员发生肢体冲突、破坏公司财物等违反治安管理规定的行为，那么此时报警是合适的。

警方到场后，会首先制止冲突行为，保障现场人员和财物的安全。然后会对冲突双方进行询问，了解事情的起因、经过等情况。对于违反治安管理的行为，警方会根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定进行处理。例如，如果员工有殴打他人行为，可能会被处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。

不过，警方主要处理的是冲突行为本身，对于工资是否应该扣、扣多少等劳动纠纷问题，警方一般不会直接作出裁决。

从工资纠纷解决角度

1. 协商：员工发现自己因为未按时上班被扣工资后，可以先与公司进行友好协商。员工可以向公司说明未按时上班的原因，如果是合理原因，比如突发疾病、遭遇不可抗力等，请求公司减少扣款或者不扣款。公司也可以向员工解释扣工资的依据和标准，双方在平等、自愿的基础上达成一致意见。
2. 劳动仲裁：如果协商不成，员工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。员工需要准备相关的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、公司扣工资的通知等，以证明自己与公司存在劳动关系以及公司扣工资的事实。劳动争议仲裁委员会会根据双方提供的证据和相关法律法规进行裁决，裁决结果具有法律效力。
3. 诉讼：如果员工对劳动仲裁裁决结果不满意，还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院会全面审查双方的证据和主张，依法作出判决。

从公司扣工资合法性角度

公司扣员工工资需要有合法的依据和合理的标准。根据《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

如果员工未按时上班并没有给公司造成经济损失，或者公司扣工资的比例超过了上述规定，那么公司的扣工资行为可能是不合法的，员工有权要求公司返还多扣的工资。

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