结论：实习学生做了两个月因不合格被辞退，一般情况下是没有经济补偿的，但具体还需根据实习协议的约定以及实际情况来判断。
分析说明：
实习关系的性质：
- 实习学生与用人单位之间通常建立的是实习关系，而非劳动关系。实习关系主要基于教育、培训或实践的目的，与正式的劳动关系在法律性质上有所不同。
经济补偿的法律依据：
- 在劳动关系中，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在特定情况下（如违法解除劳动合同、未按照约定支付劳动报酬等）需要向劳动者支付经济补偿。
- 然而，在实习关系中，由于不适用劳动合同法的规定，因此通常不存在因“不合格”被辞退而支付经济补偿的法律依据。
实习协议的约定：
- 实习协议是实习学生与用人单位之间约定双方权利和义务的重要文件。如果实习协议中明确约定了因实习学生不合格被辞退时用人单位需要支付经济补偿的条款，那么用人单位应当按照协议约定履行。
- 如果实习协议中没有相关约定，或者约定不明确，那么通常不会因“不合格”被辞退而获得经济补偿。
实际情况的考量：
- 除了实习协议的约定外，还需要考虑实际情况。例如，如果实习学生确实因为用人单位的原因（如提供的工作条件不符合约定、未给予必要的指导和培训等）导致无法胜任工作而被辞退，那么用人单位可能在一定程度上需要承担责任。但这种情况下的责任承担通常不是以经济补偿的形式出现，而是可能涉及其他形式的赔偿或补偿。
特殊场景：
- 如果实习学生与用人单位之间实际上构成了劳动关系（例如，实习学生已经毕业、用人单位对实习学生进行了实质性的管理并支付了劳动报酬等），那么在这种情况下，如果用人单位因实习学生不合格而辞退，且没有合法依据，那么实习学生可能有权要求用人单位支付经济补偿。但这种情况需要具体分析，并依据相关法律法规进行判断。
行动建议：
- 审查实习协议：首先，实习学生应当仔细审查与用人单位签订的实习协议，了解其中关于辞退和经济补偿的约定。
- 与用人单位沟通：如果实习学生对辞退决定有异议或认为用人单位应当支付经济补偿，可以与用人单位进行沟通协商，寻求解决方案。
- 寻求法律帮助：如果沟通协商无果，实习学生可以咨询专业律师（如我，朱佑敏律师，专注于劳动纠纷等领域），了解自己的权益和可能的法律途径。
法律依据：
- 虽然实习关系不直接适用《中华人民共和国劳动合同法》中关于经济补偿的规定，但相关法律法规和司法实践仍可能对实习关系的处理提供一定的指导和参考。例如，可以关注当地关于实习关系的规范性文件或司法判例。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。