员工拿了公司三百元，公司可根据具体情况采取以下处理措施：

1. 内部调查与沟通
   首先，公司应启动内部调查程序，核实员工是否确实存在不当获取公司财物的行为。调查过程中，需确保程序合法合规，避免侵犯员工隐私权或其他合法权益。若调查确认员工行为属实，公司应与员工进行正式沟通，了解其行为动机及背景情况。此阶段处理重点在于教育引导，而非单纯惩罚，尤其是针对初犯或情节轻微的情况。

2. 依据规章制度处理
   若公司《员工手册》或相关规章制度中明确规定了“侵占公司财物”的处罚条款（如警告、扣减奖金、解除劳动合同等），且该制度已通过民主程序制定并公示，公司可依据制度对员工进行处分。

   • 情节轻微（如首次、金额较小、主动退还）：可给予口头/书面警告，并要求员工签署《承诺书》保证不再犯。
     
   • 情节较重（如多次、拒不退还、造成恶劣影响）：可依据制度升级处罚，甚至解除劳动合同（需符合《劳动合同法》第39条“严重违反规章制度”的情形）。
     注意：处罚需与违规行为性质、后果及员工主观恶性程度匹配，避免过度处罚引发劳动争议。

3. 法律追责（如需）
   若员工行为涉嫌违法（如职务侵占罪），公司可向公安机关报案。根据《刑法》第271条，职务侵占罪立案标准为“数额较大”（通常为6万元以上），但部分地区可能降低标准（如3万元）。本案中300元未达刑事立案标准，但若员工存在多次小额侵占、累计金额较大，或通过伪造单据等手段实施，可能涉嫌犯罪。
   建议：即使不追究刑事责任，公司也可通过民事诉讼要求员工返还财物并赔偿损失（需保留转账记录、监控录像等证据）。

4. 完善管理机制
   事件处理后，公司应反思管理漏洞（如财物保管、审批流程等），通过修订制度、加强培训、安装监控等方式预防类似事件再次发生。例如，明确小额财物领取需双人经手、定期盘点库存等。

温馨提示：处理此类事件时，公司需平衡“维护权益”与“避免法律风险”。若对证据收集、制度适用或处罚程序存疑，可直接向我咨询，我会结合具体细节提供操作建议。