结论：单位是否会查询无犯罪记录证明电子版，主要取决于具体的情境、法律规定以及单位的内部规定。在特定行业、岗位或情境下，单位可能会查询；而在其他情况下，单位则通常不会主动查询。
详细分析：
特定行业或岗位的招聘：
- 在涉及国家安全、公共安全或重大利益的岗位，如政府部门中的机要、保密岗位，国防科研单位的核心研发岗位，金融行业的关键职位，以及教育行业中涉及未成年人教育的岗位等，单位在招聘时可能会严格审查应聘者的无犯罪记录。这种情况下，即使应聘者提供了无犯罪记录证明的电子版，单位也可能会通过官方渠道进行核实。
内部管理和风险防控需要：
- 一些单位为了加强内部管理、降低潜在法律风险，可能会对所有新入职员工进行背景调查，包括查询无犯罪记录证明。这种情况下，单位可能会要求应聘者提供无犯罪记录证明的原件或电子版，并进行核实。
法律法规或行业规定要求：
- 某些行业受到特定法律法规的严格监管，要求从业者必须具备无犯罪记录。例如，律师、注册会计师、医生、教师等职业在申请执业资格时，需要提供无犯罪记录证明。在这种情况下，相关单位或行业协会在审核申请时，会查询或要求提供无犯罪记录证明。
普通岗位招聘或小型企业、创业公司：
- 对于劳动强度较大、技能要求相对较低的普通岗位，或者资源有限、人力成本考虑的小型企业、创业公司，在招聘时可能不会进行全面的背景调查，包括查询无犯罪记录证明。这种情况下，即使应聘者提供了无犯罪记录证明的电子版，单位也可能不会进行核实。
临时或兼职工作：
- 对于短期的临时工作或兼职工作，单位一般不会花费时间和精力去查询应聘者的无犯罪记录。因此，在这种情况下，提供无犯罪记录证明的电子版通常不是必要的。
法律建议：
- 对于个人而言：在应聘特定岗位或从事特定职业时，应提前了解是否需要提供无犯罪记录证明，并按照规定流程向公安机关申请开具。如果单位要求提供电子版，应确保电子版的真实性和有效性，并了解单位是否会进行核实。
- 对于单位而言：在招聘或内部管理过程中，应遵守相关法律法规和行业规定，合理确定是否需要查询应聘者的无犯罪记录证明。如果需要查询，应确保查询过程的合法性和合规性，并尊重应聘者的隐私权。
可能后果：
- 如果单位在需要查询无犯罪记录证明的情况下未进行查询，而应聘者实际上存在犯罪记录，可能会给单位带来潜在的法律风险和安全隐患。
- 如果单位在不需要查询的情况下进行了查询，可能会侵犯应聘者的隐私权，并可能引发不必要的纠纷和争议。
总之，无犯罪记录证明的查询与提供是一个涉及个人隐私和单位管理的复杂问题。在处理这类问题时，应综合考虑多种因素，并严格遵守相关法律法规和行业规定。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。