结论：购房合同补充条款中约定保修期从通知收房起算，有可能被申请认定为格式条款无效，但具体需结合条款内容、制定过程及是否显失公平等因素综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、格式条款的认定标准

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十六条的规定，格式条款是当事人为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与对方协商的条款。若购房合同补充条款中的保修期起算约定符合以下特征，则可能被认定为格式条款：

1. 预先拟定性：该条款由开发商事先拟定，购房者未参与制定过程。
2. 重复使用性：该条款被开发商在多份购房合同中重复使用。
3. 未协商性：购房者在签订合同时，无法就该条款与开发商进行协商或修改。

二、格式条款无效的情形

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十七条的规定，有下列情形之一的，该格式条款无效：

1. 免除或减轻自身责任：若保修期起算条款的约定，实质上免除了开发商在房屋交付前应承担的质量责任，或减轻了其保修义务，则可能因显失公平而被认定无效。
2. 加重对方责任：若该条款的约定，使得购房者在房屋交付后承担了不合理的质量风险，如因开发商通知收房延迟而导致保修期缩短，从而加重了购房者的责任，也可能被认定无效。
3. 排除对方主要权利：若保修期起算条款的约定，排除了购房者在房屋质量问题上的主要权利，如要求开发商承担保修责任的权利，则同样可能被认定无效。

三、具体案例分析

在实际操作中，法院会结合以下因素综合判断保修期起算条款是否有效：

1. 条款内容：审查条款是否明确、合理，是否对双方权利义务进行了公平分配。例如，若条款仅规定保修期从通知收房起算，但未明确通知收房的具体时间或方式，可能导致购房者无法及时行使权利，从而被认定无效。
2. 制定过程：审查开发商在制定条款时是否遵循了公平、诚信原则，是否给予了购房者充分的知情权和选择权。若开发商在签订合同时未对购房者进行充分提示或说明，导致购房者对条款内容存在误解或不知情，也可能影响条款的效力。
3. 实际履行情况：审查双方在实际履行过程中是否按照条款约定执行。若开发商在通知收房时存在故意延迟或隐瞒房屋质量问题等行为，导致购房者无法及时行使保修权利，则可能构成违约或欺诈，从而影响条款的效力。

四、法律建议

1. 购房者角度：在签订购房合同时，应仔细阅读合同条款，特别是补充条款中的保修期起算约定。若对该条款存在疑问或不满，应及时与开发商进行协商或修改。若开发商拒绝协商或修改，购房者应谨慎考虑是否签订合同，并保留好相关证据以备后续维权。
2. 开发商角度：在制定购房合同补充条款时，应遵循公平、诚信原则，确保条款内容明确、合理，并给予购房者充分的知情权和选择权。同时，在通知收房时，应确保通知的及时性和准确性，避免因通知不当而导致保修期起算争议。

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