结论：发票开具对象需根据三方协议的具体约定及实际交易性质综合判断，通常存在两种处理方式：1. 按实际交易关系开具给甲方；2. 按资金流向开具给丙方。以下结合法律与实务角度展开分析：

一、按实际交易关系开具给甲方（常见情形）

根据《发票管理办法》第十九条及税法“三流一致”原则（合同流、资金流、发票流），若三方协议明确约定：

1. 交易本质：丙方仅作为甲方指定的付款方，实际购买方为甲方（如甲方委托丙方付款，但合同签订、货物/服务接收、结算条款均指向甲方）；
2. 权利义务：甲方承担付款义务（即使通过丙方账户支付），丙方付款行为视为代付，不改变交易主体；
3. 税务合规：为避免虚开发票风险，发票应开具给实际享受权利、承担义务的甲方。

实务建议：

• 在协议中明确约定“丙方代付不改变交易主体，发票开具对象为甲方”；
  
• 保留甲方指示付款的书面证据（如邮件、函件）；
  
• 确保货物/服务交付对象与合同主体一致（如送货单、验收单显示甲方签收）。

二、按资金流向开具给丙方（特殊情形）

若三方协议约定或实际履行中存在以下特征，发票可开具给丙方：

1. 交易重构：丙方实际参与交易，成为合同一方（如丙方与乙方重新签订合同，甲方仅作为担保方或见证方）；
   
2. 权利转移：甲方将债权债务概括转移给丙方（需经乙方书面同意）；
   
3. 税务筹划：丙方需凭发票抵扣进项税或列支成本（如丙方为集团内部资金池主体，统一付款并要求发票开具至自身）。

实务风险：

• 若无合法依据将发票开具给丙方，可能被税务机关认定为“虚开发票”（即使资金由丙方支付）；
  
• 乙方需承担举证责任，证明丙方为实际交易方（如合同变更协议、三方确认函）。

三、关键操作建议

1. 协议条款设计：
   
   • 明确约定“付款方与发票开具对象的关系”（如“丙方代付，发票开具至甲方”）；
     
   • 增加“税务责任条款”（如因发票开具问题导致税务损失，由责任方承担）。
     
2. 资金与物流匹配：
   
   • 避免出现“资金由丙方支付，但货物交付至甲方”的矛盾情形；
     
   • 若必须代付，可通过“三方备忘录”形式固定资金流向与交易关系。
     
3. 税务沟通：
   
   • 提前与主管税务机关沟通，确认发票开具方式的合规性；
     
   • 保留完整证据链（协议、付款凭证、交付单据等）以备核查。

总结：发票开具对象需以“实际交易关系”为核心，结合协议约定与资金流向综合判断。建议通过协议条款明确各方权利义务，并确保物流、资金流、发票流一致，以降低税务风险。如有具体协议文本或交易细节，可进一步分析优化方案。