关于结算书审计预留金是否合法的问题，这主要取决于具体的合同条款、相关法律法规以及审计的具体情境。以下是我为您提供的详细分析：
首先，我们需要明确的是，审计机关依法对机关、事业单位和国有大型企业支付中小企业款项情况实施审计监督，这是《保障中小企业款项支付条例》中的明确规定。然而，该条例也明确指出，机关、事业单位和国有大型企业不得强制要求以审计机关的审计结果作为结算依据，除非法律、行政法规另有规定。
合同条款的约定：
- 如果合同中明确约定了以审计结果作为结算依据，并且这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么预留金作为审计后结算的一部分，可能是合法的。
- 如果合同中没有明确约定以审计结果作为结算依据，或者约定了但违反了相关法律法规的强制性规定，那么预留金作为审计后结算的依据就可能存在问题。
相关法律法规的规定：
- 根据《保障中小企业款项支付条例》，机关、事业单位和大型企业不得以等待竣工验收备案、决算审计等为由，拒绝或者迟延支付中小企业款项。这意味着，如果预留金是以等待审计结果为由而迟延支付，且没有法律、行政法规的明确依据，那么这种做法可能是不合法的。
- 同时，我们也需要参考《中华人民共和国审计法实施条例》等相关法律法规，以了解审计机关的职权行使范围、审计程序以及审计结果的运用等，从而判断预留金的合法性。
审计的具体情境：
- 审计的目的是为了确保财务信息的真实性和准确性，保护国家和公共利益。如果审计过程中发现了问题，如虚报、瞒报等，那么预留金可能作为处理这些问题的一种手段。
- 但是，如果审计过程本身存在问题，如审计程序不合法、审计结果不公正等，那么以审计结果为依据的预留金就可能受到质疑。
综合建议：
- 在签订合同时，应明确约定结算方式和审计条款，以避免后续纠纷。
- 如果遇到以审计结果为由预留金的情况，应首先审查合同条款和相关法律法规，判断预留金的合法性。
- 如果认为预留金不合法或存在争议，可以与对方协商解决，或者寻求法律途径维护自己的合法权益。
总之，结算书审计预留金的合法性取决于合同条款、相关法律法规以及审计的具体情境。在处理这类问题时，应谨慎审查相关条款和规定，以确保自己的权益得到保障。