合同签订时是否需要写清楚审计预留金额，需根据合同类型、交易性质及双方需求综合判断，但明确约定通常更有利于风险防控。以下分情况说明：

1. 政府投资项目或涉及财政资金使用的合同
   根据《中华人民共和国审计法》及《政府投资项目审计规定》，此类项目必须接受审计监督，且审计结果可能直接影响工程价款结算。因此，合同中应当明确约定审计预留金额的比例、支付条件及审计争议解决方式（如以审计结果作为最终结算依据，或约定审计误差范围及调整机制）。若未约定，可能导致结算争议时缺乏明确依据，增加诉讼风险。

2. 企业间商业合同（非政府投资项目）
   若合同不涉及财政资金，审计条款并非强制性要求，但双方可自愿约定：

   • 约定审计预留金额：适用于长期合作、金额较大或需第三方监督的交易（如建设工程、大型设备采购）。此时需明确预留比例（如5%-10%）、审计机构资质、审计报告出具时限及超期处理方式，避免因审计拖延影响资金周转。
     
   • 不约定审计预留金额：适用于短期、小额或信任度较高的交易（如普通货物买卖）。此时可约定“以双方确认的结算单为准”，或直接约定付款期限，减少程序性争议。

3. 国际工程合同或跨境交易
   若适用FIDIC合同条件或国际惯例，通常需约定审计（或“争端裁决委员会”审查）条款，并明确预留金额比例（如5%）及支付节点（如竣工后支付95%，预留5%待审计后支付）。此类约定需符合项目所在国法律，避免因条款冲突导致无效。

风险提示：

• 若合同约定“以审计结果为准”但未明确审计机构选择方式，可能因一方单方委托审计导致结果不被对方认可；
  
• 预留金额比例过高可能影响承包方资金流动性，需在合同中约定利息补偿或分期支付条款；
  
• 审计范围（如是否包含变更签证、索赔费用）需在合同中明确，避免审计时扩大范围引发争议。

建议：
根据交易性质评估审计必要性，若需约定，务必细化条款（如“预留合同总价5%作为审计保证金，审计完成后30日内支付余款，审计误差超过3%时双方共同委托第三方复审”）。如有具体合同类型或场景，可进一步向我咨询条款设计细节。