结论：医院作为事业单位按企业方式缴纳社保是否合法，需分情况讨论，关键在于其是否完成事业单位向企业的改制，以及是否依法调整社保缴纳方式。

1. 若医院已完成事业单位改制为企业
   根据《社会保险法》及相关政策，企业需按照企业职工的标准缴纳社保（即“五险”：养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险）。若医院已通过改制登记为企业（如公立医院转为国有独资公司、股份制医院等），则其按企业方式缴纳社保是合法的，但需确保：

   • 改制程序合法（如经主管部门批准、资产清算、职工安置方案合规等）；
     
   • 社保缴纳基数符合职工实际工资水平，避免少缴、漏缴；
     
   • 依法为职工缴纳住房公积金（企业义务，事业单位可能不强制）。
     

2. 若医院仍为事业单位性质
   事业单位社保缴纳通常遵循《事业单位人事管理条例》及地方规定，一般缴纳“机关事业单位养老保险”（部分地区已试点与企业养老并轨），并可能包含职业年金。此时：

   • 按企业方式缴纳社保不合法：事业单位未完成改制前，擅自按企业标准缴纳社保可能违反财政、人事管理规定，损害职工权益（如退休待遇差异）；
     
   • 例外情形：若地方试点事业单位与企业社保并轨（如部分省份已统一养老制度），且医院已纳入试点范围，则需按试点政策调整，但需以正式文件为依据。
     

3. 实务建议

   • 对医院：若计划改制，需提前评估社保成本变化（企业缴费比例通常高于事业单位），并依法履行职工代表大会审议、备案等程序；
     
   • 对职工：若发现单位违规缴纳社保，可向当地社保部门投诉（如12333热线），或通过劳动仲裁主张权益（如补缴社保、赔偿损失）。
     

提示：社保政策具有地域性，具体操作需结合当地人社部门规定。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。