针对您提出的问题，即“以农村村民户口名义申请宅基地，第三方在此修建房屋并居住是否违法，以及起诉是否会赢”，以下是我的详细解答：
一、关于违法性的分析
宅基地申请与审批：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第六十二条第四款规定，农村村民住宅用地须经乡（镇）人民政府审核批准。这意味着，任何在农村宅基地上建房的行为，都必须事先获得相关政府部门的审批。
- 宅基地的申请和审批流程是严格的，包括向村委会提交申请材料、村集体讨论、公示、乡镇政府组织人员踏勘、审查等多个环节。未经审批或超出审批范围建房，均属于违法行为。
第三方建房与居住：
- 如果第三方未经宅基地使用权人（即申请并获得审批的农村村民）的同意，擅自在其宅基地上修建房屋并居住，这显然侵犯了宅基地使用权人的合法权益。
- 此外，如果第三方建房行为未获得相关政府部门的审批，那么该行为还违反了土地管理法的相关规定，属于非法占地建房。
二、关于起诉的胜诉可能性
起诉的法律依据：
- 如果第三方未经批准或超出批准范围在您的宅基地上建房并居住，您有权依据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，向人民法院提起诉讼，要求第三方停止侵权行为、恢复原状或赔偿损失。
胜诉的关键因素：
- 证据充分：您需要提供充分的证据证明您是宅基地的合法使用权人，以及第三方未经您的同意擅自建房并居住的事实。这可能包括宅基地使用权证、建房审批文件、现场照片、视频等。
- 法律适用正确：在起诉过程中，您需要正确引用相关法律法规，说明第三方的行为违反了哪些法律规定，以及您因此遭受了哪些损失。
- 程序合法：您需要按照法律规定的程序进行起诉，包括提交起诉状、缴纳诉讼费、参加庭审等。
可能的诉讼结果：
- 如果法院认定第三方的行为确实违法，且您的诉讼请求合理合法，那么法院有可能会判决第三方停止侵权行为、恢复原状或赔偿损失。
- 然而，如果证据不足或法律适用不当，或者第三方能够提出合理的抗辩理由（如经过您的同意或存在其他合法情形），那么您可能会面临败诉的风险。
三、建议与总结
建议：
- 在起诉前，建议您先与第三方进行协商，尝试通过和解的方式解决纠纷。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
- 在起诉过程中，建议您咨询专业律师的意见，以确保您的诉讼请求合理合法，且证据充分、程序合法。
总结：
- 第三方未经批准或超出批准范围在您的宅基地上建房并居住，属于违法行为。您有权依据相关法律法规向人民法院提起诉讼，要求第三方停止侵权行为、恢复原状或赔偿损失。
- 起诉的胜诉可能性取决于证据的充分性、法律适用的正确性以及程序的合法性。因此，在起诉前，建议您做好充分的准备和咨询工作。