结论：在您描述的情况下，是否可以申请赔偿取决于多个因素，包括三方协议的具体内容、合同主体变更的性质以及您因此遭受的实际损失等。以下是从不同角度进行的分析：

1. 三方协议的内容与效力：

   • 三方协议是您、原公司和新公司之间就合同主体变更事宜达成的协议。如果协议中明确约定了因主体变更导致的赔偿事宜，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么您有权依据协议要求赔偿。
   • 如果三方协议未明确约定赔偿事宜，但您能证明因主体变更导致您遭受了实际损失（如工资损失、福利损失等），且该损失与主体变更存在直接因果关系，那么您可能仍有权要求赔偿，但需要依据相关法律法规和实际情况进行判断。

2. 合同主体变更的性质：

   • 如果合同主体变更属于合法、合规的变更，且新公司愿意承担原公司的权利和义务，那么您通常不能仅因主体变更而要求赔偿。但是，如果新公司拒绝履行原合同中的义务，导致您遭受损失，您可以要求新公司承担赔偿责任。
   • 如果合同主体变更存在违法或违规情形（如未经您同意擅自变更、变更过程中存在欺诈等），那么您有权要求赔偿，并可能涉及对原公司和新公司的法律追责。

3. 实际损失的证明：

   • 无论哪种情况，要申请赔偿，您都需要证明自己因合同主体变更遭受了实际损失。这通常需要您提供相关证据，如工资单、福利证明、工作记录等。
   • 如果您无法证明自己遭受了实际损失，或者损失与合同主体变更无直接因果关系，那么您的赔偿请求可能难以得到支持。

法律建议：

• 首先，仔细审查三方协议的具体内容，特别是关于赔偿的条款。如果协议中有明确约定，且您符合赔偿条件，那么您可以依据协议要求赔偿。
• 其次，收集并整理相关证据，证明自己因合同主体变更遭受了实际损失。这些证据将对您申请赔偿至关重要。
• 最后，如果与新公司协商无果，或者您认为自己的权益受到严重侵害，建议及时寻求法律援助或向相关部门投诉，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果您能够证明自己因合同主体变更遭受了实际损失，并且符合赔偿条件，那么您有可能获得相应的赔偿。
• 如果您无法证明自己遭受了实际损失，或者损失与合同主体变更无直接因果关系，那么您的赔偿请求可能被驳回。
• 如果合同主体变更存在违法或违规情形，您不仅可能获得赔偿，还可能涉及对原公司和新公司的法律追责。

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