合同双方在合同存续期间如发生争议，并不一定等同于因本合同引起的争议。这一问题的答案取决于争议的具体内容、性质以及其与合同条款之间的关联性。以下从几个不同角度进行分析：
争议内容与合同条款直接相关：
- 如果争议的内容直接涉及合同条款的解释、履行、变更或终止等方面，那么这种争议显然可以视为因本合同引起的争议。例如，双方对合同中的某一条款存在不同理解，或者一方未按照合同约定履行义务，导致另一方遭受损失，这些都属于因本合同引起的争议。
争议内容与合同条款间接相关：
- 有些争议可能并非直接针对合同条款，但与合同的履行或执行环境有关。例如，在合同履行过程中，因市场环境变化、政策调整等外部因素导致双方产生分歧，这种争议虽然不直接涉及合同条款，但仍然是在合同存续期间发生的，且可能间接影响合同的履行。这种情况下，争议是否被视为因本合同引起，可能需要根据具体情况和合同中的相关条款（如不可抗力条款、情势变更条款等）来判断。
争议内容与合同完全无关：
- 如果争议的内容与合同条款、合同履行或执行环境等完全无关，那么这种争议显然不能被视为因本合同引起的争议。例如，双方在合同存续期间因个人恩怨或完全无关的商业活动产生争议，这种争议与合同本身没有直接联系。
法律建议：
- 在签订合同时，建议双方明确约定争议解决的方式和范围，包括争议是否仅限于因合同本身引起的争议，以及是否包括与合同履行或执行环境有关的争议。
- 如果合同中没有明确约定，双方在发生争议时应首先尝试通过友好协商解决。如果协商不成，可以根据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议提交仲裁，或者依法向人民法院提起诉讼。
- 在处理争议时，双方应充分收集证据，包括合同文本、履行过程中的相关文件、通信记录等，以证明自己的主张。
可能的法律后果：
- 如果争议被认定为因本合同引起，那么双方将需要根据合同条款和法律规定来解决争议，可能涉及违约责任的承担、损害赔偿的计算等问题。
- 如果争议被认定为与合同无关，那么双方可能需要通过其他途径（如民事诉讼、行政诉讼等）来解决争议，这将可能增加解决争议的成本和时间。
综上所述，合同双方在合同存续期间如发生争议，并不一定等同于因本合同引起的争议。具体是否因合同引起，需要根据争议的内容、性质以及其与合同条款之间的关联性来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。