针对“开工红包迟来的员工如何处理”这一问题，需结合公司制度、劳动法规定及公平性原则综合考量，具体处理方式如下：

1. 核查公司制度与红包性质
   首先需明确开工红包的性质：若红包属于公司福利（如年终奖、节日补贴），则其发放规则应遵循公司制度或劳动合同约定。若制度中明确规定了发放时间、条件（如需在岗满一定期限），则迟发员工是否符合条件需严格对照制度执行。

   • 若员工符合条件但未发放：公司应补发红包，并可向员工说明延迟原因（如财务流程、系统故障等），避免员工误解为歧视或克扣。
     
   • 若员工不符合条件（如未按时返岗、未完成试用期）：公司无需发放，但需向员工解释制度依据，避免争议。

2. 区分红包与法定劳动报酬
   若开工红包被认定为工资组成部分（如固定金额、与出勤挂钩），则其性质属于劳动报酬，受《劳动法》《劳动合同法》保护。

   • 迟发构成违法：根据《工资支付暂行规定》，工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付，逾期可能面临行政处罚（如劳动监察部门责令支付）及员工主张赔偿的风险。
     
   • 处理建议：公司应立即补发，并调整工资发放流程以确保合规；若因经营困难需延迟，需与员工协商并签订书面协议，明确延迟期限及补偿方案。

3. 公平性原则与员工关系管理
   即使红包属于福利，公司也应遵循公平原则，避免因迟发导致员工不满或群体性争议。

   • 差异化处理风险：若公司仅对部分员工迟发红包（如新员工、特定部门），可能被认定为歧视或未提供同等劳动条件，员工可依据《劳动合同法》第38条主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿。
     
   • 建议措施：公司应统一发放标准，若因客观原因需延迟，需通过公告、邮件等方式向全体员工说明，并明确补发时间；对已离职或未返岗员工，可协商延期发放或通过其他方式补偿。

4. 法律风险防范

   • 完善制度：公司应在规章制度中明确红包的性质、发放条件及流程，并经民主程序（如职工代表大会）审议通过，确保合法有效。
     
   • 书面记录：对红包发放的异常情况（如迟发、扣发）需留存书面记录（如员工签字确认的说明、协商记录），避免口头约定导致举证困难。
     
   • 争议解决：若员工主张权利，公司应积极沟通，必要时通过劳动仲裁或诉讼解决，避免矛盾升级。

总结：公司应根据红包性质、制度规定及公平原则处理迟发问题，优先补发符合条件的员工红包，完善制度并加强沟通，以降低法律风险及员工关系危机。如有具体案例或制度条款需进一步分析，可直接向我咨询。