结论：司机在撞死牛后赔了钱却不让拉牛，这一行为是否有法律依据，需分情况讨论。一般情况下，司机在赔偿后有权处理被撞死的牛，但若存在特殊约定或法律另有规定，则可能受到限制。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的法律依据
物权法原理：
- 在司机撞死牛的情况下，牛作为财产，其所有权原本属于牛的主人。然而，当司机因过错导致牛死亡，并承担了赔偿责任后，从某种意义上说，司机已经“买断”了这头牛的残值（即牛的尸体及其可能产生的价值）。
- 根据物权法的一般原理，赔偿后，司机有权对被撞死的牛进行处置，包括拉走牛的尸体。
合同关系：
- 如果司机与牛的主人之间就赔偿事宜达成了书面或口头协议，且协议中明确规定了司机在赔偿后有权拉走牛的尸体，那么司机就有权依据协议执行。
- 即便没有明确的书面协议，如果双方在实际操作中形成了惯例或默契，且这种惯例或默契不违反法律法规的强制性规定，也可以作为司机行使权利的依据。
二、特殊情况下的法律限制
存在特殊约定：
- 如果司机与牛的主人之间在赔偿协议中明确约定了司机不得拉走牛的尸体，或者牛的主人提出了其他合理的限制条件（如要求司机支付额外的处理费用等），那么司机就需要遵守这些约定。
法律另有规定：
- 在某些特殊情况下，法律可能对动物尸体的处理有特别规定。例如，如果牛是因为患有传染病而被撞死，那么根据相关法律法规的规定，牛的尸体可能需要由专门的机构进行处理，以防止疫情的扩散。在这种情况下，司机即使赔偿了，也可能无权拉走牛的尸体。
三、建议与措施
协商解决：
- 如果司机与牛的主人之间就牛的尸体处理问题产生了争议，建议双方首先通过协商的方式解决。通过友好沟通，双方可以达成一个互利共赢的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，司机可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我），以了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决途径。在必要时，司机还可以向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
最后，司机在撞死牛后赔了钱却不让拉牛的行为是否有法律依据，取决于双方之间的约定以及法律的具体规定。在一般情况下，司机在赔偿后有权处理被撞死的牛；但在特殊情况下，可能受到法律或约定的限制。因此，在处理此类问题时，建议双方保持冷静和理性，通过协商或法律途径解决争议。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。