结论：是否可以起诉，取决于年终奖发放的具体情况，包括发放依据、双方约定以及是否存在违法情形等。以下从不同角度进行分析：
一、年终奖发放的法律依据与约定
法律依据：年终奖并非法律强制要求发放的福利，而是用人单位根据自身经营状况、员工表现等因素自主决定是否发放的奖励。因此，年终奖的发放通常依赖于用人单位的规章制度或劳动合同中的约定。
双方约定：如果用人单位在劳动合同或规章制度中明确规定了年终奖的发放条件、标准或金额，那么用人单位应当按照约定履行。若用人单位未按照约定发放年终奖，员工有权要求用人单位按照约定支付。
二、年终奖发放6万与9万的情况分析
若用人单位有明确约定：
- 如果用人单位在劳动合同或规章制度中明确规定了年终奖的金额为9万，但实际只发放了6万，那么用人单位的行为构成违约。员工可以依据劳动合同或规章制度的规定，要求用人单位支付剩余的3万年终奖，并有权通过法律途径维护自己的权益，包括起诉用人单位。
若用人单位无明确约定：
- 如果用人单位没有在劳动合同或规章制度中明确规定年终奖的金额，或者规定较为模糊，那么年终奖的发放就具有一定的灵活性。在这种情况下，用人单位根据自身经营状况、员工表现等因素自主决定发放6万年终奖，并不构成违法。员工虽然可能对此有异议，但通常难以通过法律途径要求用人单位支付更多的年终奖。
三、起诉的可行性与建议
起诉的可行性：
- 在用人单位有明确约定且未按照约定发放年终奖的情况下，员工起诉用人单位要求支付剩余年终奖是可行的。但需要注意的是，起诉前应当收集充分的证据，如劳动合同、规章制度、年终奖发放记录等，以证明用人单位的违约行为。
建议：
- 在决定起诉前，员工可以尝试与用人单位进行协商，寻求和解或调解的方式解决争议。这不仅可以节省时间和精力，还可以维护双方的关系。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以寻求更快捷、更经济的解决方式。
- 若劳动仲裁结果不满意或用人单位不履行仲裁裁决，员工再考虑向法院提起诉讼。
进一步思考：年终奖的发放问题往往涉及用人单位与员工之间的利益平衡。作为员工，应当了解自己的权益和用人单位的规章制度；作为用人单位，也应当遵守法律法规和劳动合同的约定，合理、公平地发放年终奖。在遇到争议时，双方应当通过合法、合理的途径解决，以维护劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。