在行政处罚办案过程中，若企业再次发生违法行为，其处罚方式需结合具体情况来判定，以下是详细分析：

1. 若两次违法行为独立且不构成连续或继续状态：

   • 分别处罚原则：行政机关将针对每次违法行为分别进行调查取证，并根据各自的违法情节、性质、后果等因素，依法独立作出行政处罚决定。这意味着企业将面临两次或多次独立的行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停产停业等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。但此处的“同一个违法行为”指的是单一、独立的违法行为。若企业再次实施不同的违法行为，则不受此限制。

2. 若两次违法行为构成连续或继续状态：

   • 合并处罚或从重处罚：如果企业的两次违法行为在时间上连续或存在继续状态，且性质相同或相似，行政机关可能会考虑将其视为一个整体进行处罚，或者根据违法行为的持续时间和严重程度，从重处罚。
   • 具体情形分析：例如，企业未取得许可证擅自生产，且在行政机关调查期间仍继续生产，这种行为就构成了继续状态。行政机关在处罚时，可能会将调查期间的生产行为也纳入处罚范围，或者根据违法行为的持续时间增加罚款额度。

3. 考虑企业的整改情况：

   • 整改到位与未整改：如果企业在第一次违法行为后积极整改，且整改到位，行政机关在处罚第二次违法行为时，可能会酌情考虑其整改情况，从轻或减轻处罚。反之，如果企业未整改或整改不到位，行政机关则可能会从重处罚。
   • 法律依据与裁量权：行政机关在行使处罚权时，需遵循法定程序，并根据违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素，合理行使裁量权。

4. 特殊情形下的处罚：

   • 累犯或情节严重：如果企业多次违法，且情节严重，构成累犯或符合其他从重处罚的情形，行政机关可能会依法给予更严厉的处罚，如吊销许可证、责令关闭等。
   • 刑事责任追究：如果企业的违法行为涉嫌犯罪，行政机关将及时将案件移送司法机关，依法追究其刑事责任。

总结与建议：

• 企业应严格遵守法律法规，避免再次发生违法行为。
• 若企业已发生违法行为，应积极配合行政机关的调查，主动整改，以减轻或避免更严厉的处罚。
• 企业在面对行政处罚时，如有异议或需要法律帮助，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。