结论：保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于保险条款约定、事故性质及驾驶人是否存在故意或重大过失。以下从不同角度展开分析：

1. 保险条款的约定是核心依据

• 车损险的覆盖范围：若车辆投保了机动车损失保险（车损险），且保险合同中未明确将“水箱破裂后继续行驶导致发动机损坏”列为免责情形，则保险公司通常需承担赔偿责任。

  • 关键点：需审查保险合同中“保险责任”和“责任免除”条款。例如，若条款约定“因碰撞、倾覆等事故导致车辆损失，保险人负责赔偿”，而水箱破裂属于事故直接后果，则发动机损坏可能被纳入赔偿范围。
    
  • 例外情形：若条款明确约定“因驾驶人故意或重大过失导致损失扩大，保险人不赔”，且能证明驾驶人明知水箱破裂仍继续行驶（如水温表已报警），则可能拒赔。

• 附加险的覆盖情况：若发动机损坏因涉水导致（如水箱破裂后车辆涉水行驶），需确认是否投保了发动机特别损失险（涉水险）。若未投保，保险公司可能以“发动机进水不属于车损险赔偿范围”为由拒赔。

2. 事故性质影响赔偿结果

• 单方事故 vs 双方事故：

  • 若事故为单方事故（如驾驶人操作失误导致水箱破裂），且无免责情形，保险公司通常需赔偿。
    
  • 若事故涉及第三方（如碰撞导致水箱破裂），且第三方负全责，则发动机损坏应由第三方保险公司赔偿，与自身车损险无关。

• 事故与损失的因果关系：

  • 保险公司可能主张“水箱破裂与发动机损坏无直接因果关系”，例如水箱破裂后未及时停车导致发动机过热损坏。此时需结合事故现场证据（如行车记录仪、维修记录）证明损失的合理性。

3. 驾驶人是否存在故意或重大过失

• 故意行为：若驾驶人明知水箱破裂仍高速行驶或涉水，导致发动机损坏，可能被认定为“故意扩大损失”，保险公司有权拒赔。
  
• 重大过失：若驾驶人因疏忽未注意到水箱破裂（如水温表故障），但未采取合理措施（如未及时停车检查），保险公司可能以“未尽到减损义务”为由减少赔偿比例。

4. 实务建议

• 立即报案并固定证据：事故发生后应第一时间联系保险公司报案，并保留现场照片、维修记录等证据，避免因证据缺失导致拒赔。
  
• 审慎阅读保险条款：投保时需仔细阅读免责条款，必要时要求保险公司对模糊条款进行书面解释。
  
• 协商或诉讼解决争议：若保险公司拒赔，可先通过协商解决；协商无果的，可向当地银保监会投诉或提起诉讼，由法院根据合同约定和事实认定责任。

总结：保险公司是否赔偿需结合保险条款、事故性质及驾驶人行为综合判断。建议驾驶人在事故发生后及时报案并保留证据，必要时咨询专业律师协助处理。