工程款通常会被依法追缴，已支付的可能会被要求返还，未支付的将不再支付，同时可能面临罚款等处罚。具体来说，针对通过围标串标获取的工程，一旦被查处，工程款的处理方式会依据相关法律法规及具体情节严重程度来判定，以下是详细分析：

1. 工程款追缴与返还：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关法律法规，围标串标行为属于违法行为，其签订的合同通常会被认定为无效合同。
   • 既然合同无效，那么基于该合同所支付的工程款就失去了合法依据。因此，已支付的工程款可能会被依法追缴，并返还给相关单位或个人（如招标人）。
   • 对于尚未支付的工程款，由于合同无效，招标人通常有权拒绝支付。

2. 罚款与处罚：

   • 围标串标行为不仅会导致工程款的处理问题，还可能面临严厉的罚款和其他行政处罚。
   • 根据违法情节的严重程度，相关单位和个人可能会被处以一定数额的罚款，甚至可能面临更严重的法律后果，如吊销营业执照、禁止参与招投标活动等。

3. 实际案例与司法实践：

   • 在实际案例中，法院通常会根据围标串标行为的严重程度、对招标人造成的损失以及相关法律法规的规定，来判定工程款的处理方式和罚款数额。
   • 例如，在某些案例中，法院可能判决围标串标者返还已收取的工程款，并支付相应的罚款；在另一些案例中，法院可能仅判决罚款，而不再追缴已支付的工程款（如果招标人未遭受实际损失或损失较小）。

4. 建议与预防措施：

   • 对于招标人而言，应加强对招投标活动的监管，确保招投标过程的公开、公平、公正，防止围标串标行为的发生。
   • 对于投标人而言，应遵守相关法律法规和招投标规则，诚信参与招投标活动，避免涉及围标串标等违法行为。
   • 如果发现围标串标行为，应及时向相关部门举报，并配合调查处理工作。

如果您或您的企业涉及此类问题，或者有任何关于招投标法律方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。