结论前置：员工因旷工迟到被辞退是否合法，主要取决于用人单位的规章制度是否合法有效、员工行为是否达到严重违反规章制度的程度，以及辞退程序是否合法。若这些条件均满足，用人单位可以依法辞退员工且无需支付经济补偿。
一、用人单位规章制度需合法有效
规章制度制定程序合法：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位的规章制度需经过民主程序制定，如职工代表大会讨论、与工会或职工代表平等协商等，并向员工公示或告知，例如通过发放员工手册、组织培训签到等方式。
- 若规章制度未经民主程序制定或未向员工公示，即使员工存在旷工迟到行为，用人单位依据该规章制度辞退员工也可能被认定为违法。
规章制度内容明确：
- 规章制度中应明确规定旷工迟到的认定标准、处罚措施以及何种情况下属于严重违反规章制度。例如，规定连续旷工3天或累计旷工5天属于严重违反规章制度。
- 若规章制度中未明确规定或规定模糊，用人单位在辞退员工时可能面临法律风险。
二、员工行为需达到严重违反规章制度的程度
旷工迟到的频率与性质：
- 偶尔的旷工迟到与经常性的旷工迟到在性质上是不同的。若员工经常旷工迟到，且这种行为严重影响了工作进度和团队效率，可能被视为严重违反规章制度。
- 用人单位在规章制度中应明确规定旷工迟到达到何种程度属于严重违反，以便在辞退员工时有明确的依据。
员工行为对公司的影响：
- 若员工的旷工迟到行为给公司造成了实际且重大的经济损失或其他严重后果，如错过重要业务机会、生产停滞等，用人单位在辞退员工时可能更有法律依据。
三、辞退程序需合法
事先通知与听取申辩：
- 用人单位在辞退员工前，应事先通知员工并听取其申辩。这有助于保障员工的合法权益，避免因程序不当而引发的法律纠纷。
进行必要的调查：
- 用人单位在辞退员工前，应进行必要的调查，以确认员工确实存在旷工迟到行为且达到严重违反规章制度的程度。调查过程应公正、客观，确保辞退决定的合法性。
四、经济补偿问题
合法辞退无需支付经济补偿：
- 若员工因严重违反规章制度（如经常旷工迟到）被辞退，且辞退程序合法，用人单位通常无需支付经济补偿金。
违法辞退需支付赔偿金：
- 若规章制度不健全或违法，或辞退程序不合规，员工有权要求用人单位继续履行劳动合同；若不要求继续履行或劳动合同已不能继续履行，用人单位需按经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。
五、案例分析
- 案例一：某公司规定连续旷工3天或累计旷工5天属于严重违纪。员工小张累计旷工达到了5天，且公司有证据证明规章制度合法有效且小张知晓该规定。此时，公司可以辞退小张且不用支付补偿。
- 案例二：某公司没有正式的员工手册规定旷工的处理办法，仅口头告知员工旷工3天要辞退。员工小李旷工3天后被辞退，小李可以申请劳动仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。
总结与建议：作为用人单位，在辞退因旷工迟到的员工时，应确保规章制度的合法性和明确性，并遵循合法的辞退程序。同时，作为员工，也应了解自身权益，如有争议，可通过法律途径维护自己的合法权益。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。