对规上企业进行奖补是否违反公平竞争，需结合奖补政策的具体内容及实施方式进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
1. 奖补政策是否排除或限制了其他市场主体
若奖补政策仅针对规上企业，而排除了规下企业或其他市场主体，则可能违反公平竞争原则。例如，某市政府文件规定“一般性股改完成当年为规上（限上）企业的，以该企业完成股改前3年实际缴纳税收的平均数作为基数，增长15%以上（含）的一次性奖励50万元，增长15%以下的一次性奖励20万元”。该政策在财政奖补准入上排除了规下企业，只对规上企业完成股改进行奖励，违反了公平竞争审查制度中关于市场准入和退出的标准，即“对不同组织形式的经营者实施差别化待遇”。
若奖补政策面向所有符合条件的市场主体，不区分规上或规下，且奖补条件与市场主体的经营行为、贡献等合理因素相关，则通常不违反公平竞争原则。
2. 奖补政策是否以不合理的标准作为依据
若奖补政策以企业缴纳的税收或非税收入作为财政奖励依据，则可能违反公平竞争原则。如上述案例中，以缴纳的税收作为财政奖励依据，违反了公平竞争审查制度中关于影响生产经营成本的标准，即“安排财政支出一般不得与企业缴纳的税收或非税收入挂钩”。
若奖补政策以合理的经营指标、创新成果、社会贡献等作为依据，且这些依据与市场主体的经营行为直接相关，则通常不违反公平竞争原则。
3. 奖补政策是否设置了不合理的市场准入或退出条件
若奖补政策设置了不合理的市场准入或退出条件，如要求享受优惠政策的企业在一定期限内不得迁出该地区，或在补助准入上设置不必要的备案障碍，则可能违反公平竞争原则。例如，某县政府文件规定“享受优惠政策的企业，三年内迁出本县的，已享受优惠政策所有奖励资金应全额退还”，并设置了备案障碍，违反了公平竞争审查制度中关于市场准入和退出的标准。
若奖补政策未设置不合理的市场准入或退出条件，且奖补过程公开透明，则通常不违反公平竞争原则。
法律建议
在制定奖补政策时，应确保政策面向所有符合条件的市场主体，不区分规上或规下，避免实施差别化待遇。
奖补政策的依据应合理且与市场主体的经营行为直接相关，避免以企业缴纳的税收或非税收入作为财政奖励依据。
奖补政策不应设置不合理的市场准入或退出条件，确保市场主体能够自由进入和退出市场。
在出台奖补政策前，应进行公平竞争审查，评估政策对市场竞争的影响，防止排除、限制市场竞争。
若发现政策制定机关出台的具体政策措施涉嫌违反公平竞争审查制度，市场主体和社会公众可以拨打12345或直接向当地市场监管部门举报反映。
如有具体奖补政策需要评估其是否违反公平竞争原则，可以直接向我咨询。我将结合政策的具体内容、实施方式以及相关法律法规，为您提供专业的法律意见。