结论：未去新部门报到而在原部门打卡上班是否算旷工，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、调岗通知内容、员工实际工作情况等因素。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度角度：
- 若公司规章制度明确规定，员工在接到调岗通知后，应按时到新部门报到，未按时报到且未在原部门实际工作的，视为旷工。在此情况下，若你未去新部门报到，且在原部门并未实际从事与原岗位相关的工作（如仅打卡未工作），则公司有权依据规章制度认定你为旷工。
- 若公司规章制度未明确规定或规定不明确，则不能直接认定你为旷工。此时，需结合其他因素进行综合判断。
调岗通知内容角度：
- 若调岗通知中明确要求你于某日到新部门报到，并说明了未按时报到的后果（如视为旷工、解除劳动合同等），且你已签收该通知，则你应遵守通知要求。若未遵守，公司有权依据通知内容认定你为旷工。
- 若调岗通知未明确报到时间或未说明未按时报到的后果，则公司不能直接认定你为旷工。此时，你应与公司沟通确认报到时间及相关事宜。
员工实际工作情况角度：
- 若你在原部门打卡上班，但实际并未从事任何工作（如未接受工作安排、未提供劳动等），且公司能够证明这一点，则公司有权认定你为旷工。
- 若你在原部门打卡上班，并实际从事了与原岗位相关的工作（如完成了原岗位的工作任务、接受了原部门的工作安排等），且公司未对此提出异议，则不能直接认定你为旷工。此时，你应与公司沟通确认调岗事宜及工作安排。
法律建议：
- 建议你首先查阅公司的规章制度，了解关于调岗、旷工等相关规定。
- 回顾调岗通知的内容，确认是否明确了报到时间、未按时报到的后果等关键信息。
- 评估自己在原部门的实际工作情况，包括是否接受了工作安排、是否提供了劳动等。
- 若公司认定你为旷工并采取相应措施（如扣发工资、解除劳动合同等），而你认为该认定不成立，你可以与公司沟通协商，或向劳动仲裁机构申请仲裁，维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 若公司认定你为旷工并依据规章制度或劳动合同约定采取相应措施（如扣发工资、解除劳动合同等），而你无法证明该认定不成立，则你可能需要承担相应的法律后果，如接受公司的处罚、失去工作等。
- 若你能够证明公司认定你为旷工的依据不成立，或公司存在违法解除劳动合同等情形，则你可以要求公司承担相应的法律责任，如支付赔偿金、恢复劳动关系等。