结论：用人单位被吊销营业执照后继续雇用员工的，劳动关系是否存续需根据具体情况分析。一般情况下，劳动关系仍然存在；但在特定情况下，如企业已停止经营且无力恢复或清算期间未安排职工工作，劳动关系可能终止。
一、劳动关系一般情况下的存续
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条第五项规定，用人单位被吊销营业执照属于劳动合同可以终止的情形之一，但并未明确规定劳动关系立即终止。吊销营业执照并不直接等同于法人资格消灭，企业在未办理注销登记前，其法人主体资格仍然存续，因此劳动关系也相应延续。
司法实践倾向：
- 为保护劳动者合法权益，即使企业因违法经营等原因被吊销营业执照，只要企业尚未进行清算并办理注销登记，且仍有财产和设备，劳动关系通常被视为继续存在。例如，职工在此期间可能仍需为企业看守财产、设备等，提供一定的劳动，这进一步证明了劳动关系的延续性。
二、劳动关系特殊情况下的终止
企业停止经营且无力恢复：
- 若企业营业执照被吊销后实际已停止经营，无任何恢复经营的可能，也未为职工安排其他工作或提供劳动条件，则可认定劳动关系终止。例如，企业因严重亏损、资不抵债而被吊销营业执照，并完全停产，厂房设备均被拍卖抵债，此时劳动关系难以维持，应认定为终止。
清算期间的特殊情况：
- 企业进入清算程序后，清算组可能会根据需要安排部分职工参与清算工作，这部分职工的劳动关系在清算期间继续存在。对于未被安排参与清算工作的职工，随着清算程序的推进，劳动关系一般会逐渐终止。
三、劳动关系存续期间的法律义务与权益保护
用人单位的法律义务：
- 即使营业执照被吊销，用人单位仍需履行相应的劳动法律义务，包括支付工资、提供劳动保护等。如果劳动者在营业执照吊销后仍继续工作，用人单位应按照劳动法的规定支付劳动报酬。
劳动者的权益保护：
- 劳动者在企业营业执照被吊销后的合法权益受法律保护，如工资、经济补偿等。如用人单位未履行相应义务，劳动者可通过协商、仲裁或诉讼等方式维护自己的合法权益。
四、实践中的处理方式
协商解除：
- 用人单位与劳动者可以通过协商的方式解除劳动合同，并根据劳动者在本单位的工作年限给予相应的经济补偿。
仲裁或诉讼：
- 如双方就劳动关系的处理无法达成一致意见，劳动者可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向法院提起诉讼。
建议：对于用人单位被吊销营业执照后继续雇用员工的情况，建议双方首先通过协商明确劳动关系状态及后续处理方式。如协商无果，劳动者可及时寻求法律援助，通过仲裁或诉讼途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。